Basic Information

Symbol
SCAMP5
RNA class
mRNA
Alias
Secretory Carrier Membrane Protein 5 Secretory Carrier-Associated Membrane Protein 5 MGC24969 HSCAMP5
Location (GRCh38)
15:74957219-75021497
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138967.4
Sequence length
3379.0 nt
GC content
0.5661

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1398.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1455.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 878.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001178111.2 NCBI
CCCCGCCCCCAGCCCCGGAGCGGCUCGCGGCCGGCUCCGCGCCGCAUCG… 3462 nt 0.5653
NM_001178112.2 NCBI
CCCCGCCCCCAGCCCCGGAGCGGCUCGCGGCCGGCUCCGCGCCGCAUCG… 3429 nt 0.5675
NM_138967.4 NCBI
CCCCGCCCCCAGCCCCGGAGCGGCUCGCGGCCGGCUCCGCGCCGCAUCG… 3379 nt 0.5661
Summary

Involved in positive regulation of cytokine production; regulation of vesicle-mediated transport; and response to endoplasmic reticulum stress. Located in Golgi apparatus; plasma membrane; and recycling endosome membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified SCAMP5 as a gene marker showing promise as a diagnostic biomarker for sepsis [Chen et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1298041].