Basic Information

Symbol
SCAPER
RNA class
mRNA
Alias
S-Phase Cyclin A Associated Protein In The ER Zinc Finger Protein 291 Zfp291 ZNF291 S Phase Cyclin A-Associated Protein In The Endoplasmic Reticulum S Phase Cyclin A-Associated Protein In The ER KIAA1454 MSTP063 IDDRP
Location (GRCh38)
15:76347904-76905970
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020843.4
Sequence length
5033.0 nt
GC content
0.4218

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1341.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1431.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1055.3
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145923.2 NCBI
ACUUCUCCUUCCUGCUGCCUUGUAAAGAAGGCGCCUUGCUUGCCCUUCU… 5134 nt 0.4225
NM_001353009.2 NCBI
GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGCUCUGCC… 5229 nt 0.4284
NM_001353010.2 NCBI
GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGUGAGUG… 5194 nt 0.4284
NM_001353011.2 NCBI
GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… 5169 nt 0.4246
NM_001353012.2 NCBI
GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… 5121 nt 0.4212
NM_020843.4 NCBI
GGGACGCUUUGAGCCGCCCCGAACUAAGCAGGGCGGUCGGGGGAGUCAU… 5033 nt 0.4218
Summary

Predicted to enable nucleic acid binding activity and zinc ion binding activity. Acts upstream of or within retina development in camera-type eye. Located in cytosol and nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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