Basic Information

Symbol
SCARB1
RNA class
mRNA
Alias
Scavenger Receptor Class B Member 1 CLA-1 SR-BI SRB1 CLA1 CD36L1 CD36 Antigen (Collagen Type I Receptor, Thrombospondin Receptor)-Like 1 CD36 And LIMPII Analogous 1 Collagen Type I Receptor, Thrombospondin Receptor-Like 1 Scavenger Receptor Class B, Member 1 Scavenger Receptor Class B Type III CD36 Antigen-Like 1 CD36 Antigen HDLQTL6 HDLCQ6
Location (GRCh38)
12:124776856-124882668
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005505.5
Sequence length
3405.0 nt
GC content
0.5604

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1288.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1349.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 899.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005505.5 NCBI
CCUGCGUGCGCUGCCGUCCCGGAUCCACCGUGCCUCUGCGGCCUGCGUG… 3405 nt 0.5604
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a plasma membrane receptor for high density lipoprotein cholesterol (HDL). The encoded protein mediates cholesterol transfer to and from HDL. In addition, this protein is a receptor for hepatitis C virus glycoprotein E2 and facilitates cell entry by the virus, SARS-CoV2. [provided by RefSeq, Oct 2021]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that Cd36 is a marker for capillary endothelial cells involved in trans-endothelial lipid processing within interscapular brown adipose tissue, as identified through single-nucleus mRNA-sequencing [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252]. A study in mice demonstrated that the SCARB1 was over-expressed in liver tissue following Kupffer cell-specific and endothelial cell-specific exposures to α-particles, as well as after neutron exposure, as part of a broader inflammatory response characterized by acute-phase protein upregulation [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. In a separate study in rats, the SCARB1 was identified as a metabolism gene involved in lipid catabolism and was significantly down-regulated in liver tissue on day 2 following a 20% total body surface area burn injury [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025].