Basic Information

Symbol
SCG2
RNA class
mRNA
Alias
Secretogranin II CHGC SgII SN Secretogranin-2 Chromogranin-C Secretoneurin Chromogranin C EM66
Location (GRCh38)
2:223596940-223602361
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003469.5
Sequence length
2434.0 nt
GC content
0.4248

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-686.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -728.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 459.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003469.5 NCBI
GAAACGGCCCGAGAAGCUCGCCCGGAGAACGGGGAGGAAUAUGCUGUGG… 2434 nt 0.4248
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the chromogranin/secretogranin family of neuroendocrine secretory proteins. Studies in rodents suggest that the full-length protein, secretogranin II, is involved in the packaging or sorting of peptide hormones and neuropeptides into secretory vesicles. The full-length protein is cleaved to produce the active peptide secretoneurin, which exerts chemotaxic effects on specific cell types, and EM66, whose function is unknown. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.