Basic Information

Symbol
SEC14L2
RNA class
mRNA
Alias
SEC14 Like Lipid Binding 2 TAP SPF Supernatant Protein Factor KIAA1186 KIAA1658 C22orf6 TAP1 Alpha-Tocopherol-Associated Protein Tocopherol-Associated Protein 1 Squalene Transfer Protein SEC14-Like Protein 2 SEC14 (S. Cerevisiae)-Like 2 SEC14-Like 2 (S. Cerevisiae) SEC14-Like Lipid Binding 2 HTAP
Location (GRCh38)
22:30396941-30425303
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012429.5
Sequence length
4207.0 nt
GC content
0.5524

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1574.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1650.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1284.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204204.3 NCBI
GACUUUACUCCGGGUGGCGGCGAGGACGAGUCUGUGCUCCAUCAGCUGC… 3958 nt 0.5536
NM_001291932.2 NCBI
GACUUUACUCCGGGUGGCGGCGAGGACGAGUCUGUGCUCCAUCAGCUGC… 4131 nt 0.5522
NM_012429.5 NCBI
GACUUUACUCCGGGUGGCGGCGAGGACGAGUCUGUGCUCCAUCAGCUGC… 4207 nt 0.5524
NM_033382.3 NCBI
GACUUUACUCCGGGUGGCGGCGAGGACGAGUCUGUGCUCCAUCAGCUGC… 1752 nt 0.5228
Summary

This gene encodes a cytosolic protein which belongs to a family of lipid-binding proteins including Sec14p, alpha-tocopherol transfer protein, and cellular retinol-binding protein. The encoded protein stimulates squalene monooxygenase which is a downstream enzyme in the cholesterol biosynthetic pathway. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2008]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that SEC14L2 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].