Basic Information

Symbol
SERINC1
RNA class
mRNA
Alias
Serine Incorporator 1 TDE1L KIAA1253 TMS-2 TDE2 Tumor Differentially Expressed Protein 2 Tumor Differentially Expressed Protein 1-Like Tumor Differentially Expressed 2 TMS2
Location (GRCh38)
6:122443348-122471854
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020755.4
Sequence length
3125.0 nt
GC content
0.3834

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-830.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -892.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 921.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((......)))))..((((((((((((...((((((...((.(.(((((((((....((((((((((((((((((.(.((((((...((((((..(((((((((...))).)))))).))).))))))))).)..)))).(((((.(((((.(((((((((......)))))((((..((((....)))))))).......(((((((((.......((((((((((((...((.(((.((((((((...................)))))))).((((((....))))))..((.(((((...((((....((((((((((((....))).(((((.....)))))(((((((((((..(((((((((..((.(((((((((((.........))))))))).)).)).))...))))((((((((.......(((.......)))........))))))))..((.((((....)))).))..((((((......))))))......(((((((..(((......(((((((.((((((..((.(((.(((((.((.....(((..(((...)))..)))......(((((((((...)))))).))))).)))))))).))..((.((.((((.(((..(((((((.(((....)))))))))).(((((............)))))))).)))).)).))..))))))...))))))).........)))..)))))))..........(((((((((..(((((((((..((......)))))))))))..)).))))))))))..))))))...))))).....)))))))))(((((((((((((........)))))....(((((((...))))...))).((((((....))))))..)))))))).))))...)))))))..))).))...)))))...)))))))...)))))))))((((((........))))))(((((..((((.((((((.(((..(((((((((.(((.............))).))))......)))))..(((((((...(((......((((((.........))))))........)))..(((((((((((...((((..((.(((((..(((((((.(((...(((.((..(((((((...)))).)))..)).)))........(((((((((((.....))).))))))))))).)))))))..))))).))...))))....((((.(((((((.((..(.((((((((...((((.(..((((((((....)).))..((.((((.....)))).))))))..).))))...)))))))))..))))))))).))))...(((..((((.(((....)))(((((.((.(((((.(((((..(....(((((.((((((......).))))).)))))..)..)))))..))))))))))))(((((((.((((.((((((.((.(((((....((((.......))))......(((....(((((((......(((((((((((((((((((.((((((((((((....(((.((((..(((.....))).)))).)))....))))))))......)))).))))))))).))))))).((((((((((((.((((((...((((...(((((((.((((((....(((..(((((....))))).))))))))).))))))).))))...))))))(((((((......))))))).)))).)))))))).((((((((((.....((((((.....((((....))))....))))))...))))))))))...........)))......)))))))....))).(((((((....))))))).......))))).)))))))).)))).)))))))...))))..)))))))))))))))))))))))))))))).))))..)))))....(((((((......)))))))(((((((.....)))))))..((((((((.((....((.((.((((.(((((((((..(((...(((((......((((((((.((.....)).)))))))).....)))))....))).))))))))).)))).)).))......))))))))))...........)))).))))))))))(((((((...((..((((((....)))))).))...)))))))...(((((((.(((((((.............)))))))..)).)))))..))))))))))))))...)))).((((((((...((((....(((.(.(.(((((((........))))).))).).)))..)))).)))))))).((((((((..((((((((((....))....)))))))))))).))))))))).).))...))))))...............((((...)))).))))))....(((((.(((............)))))))).((((((.((((((((....)))).)))).)))))).(((((((.((((((....))))))))).)))).........(((((.(((((.....))))).)))))......................))).)))(((((((((((((((((((....(((((((((((....(((((...((((...((((........))))...)))))))))..((((((.(((.((((((..((((((((........))))(((((((((.((((...((((((((.........((((.(((.((((((.......((((((((.......)).))))))...((((......)))).(((.((((((((((.((((.(((.(((((..(((.........)))..)))))))))))).)))))))))).))).)))))))))...))))))))))))))))))..)))))))............(((((..((((((........).)))))..)))))................))))...))))))))).)))))))))))))))))...)))))).........))))))...)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((......))))).,((((((((((((...((((((...((.(.((((({(((....((((((((((((((((((.,.((((((...(((((({.{((((((((...))).))))))})))},)))))))).}..)))).(((((.((((({(((((((...{(,.(((((((((((((({(,,,.||||{(((((...,,(((((({{({{(((({((,,(((,((({{{,((,{{{.((((((((,,..,,.,,,,{,......}}}}||||,{{,((({{{,||{{{{{{((,({(({,,,,{(({{{,{{{{({{((((({,,,|||,(((((.....}}}}}{{{|{,,||||,,,{{((({,{,,((.(((((((((((.........))))))))).}}.||,||,..,||}((((((((,......{((,...,,,))}.......}))))))))...,,{{{{....,}})|}}|}{(((((......)))))}..,,.,{({{{((|,(((,,..,,({(((((,{{{{{{.}||,|||,|||||,||}}}},{||,,|{{{..,,,..,})}},,,.{{{((((((,,.}})}}}.))))),}}}},,,,,|||}||,|{,({{{.{{{,.(({((({.{({,...)))}}))))).{((((...,......,.)))))}}}.}))),)}.}},}))},}}},,}}))}}},.,,,..,,)))|.}}}))))|,,,......,||||||||,.|||,{|{||}}||}},...||||||||}},.{{|{{||,,||..{(((.,,,|,,.{{||{,,{(........)))})))|}},,..)))}....})..))})))}.,{||,|,,|||},{{|,|{((((((....)))))},)),,,)))}.})},...}}},,,}..|||,||,,{||||,,|||}}|||}||{||||||||{{(((((,...,,,.}|}}}}}|{{|||{{{||{||||||||.,,(((((((.,.,,,}}}}}}.,,..,})))})))},,...,||{||{,{(((,{{,,{({,......((((((.........))))))......,,|{|{{..,{{,|}}},.,,}},}}}|{}||||{||||{((({.{{{,{{(((|(({|((((((({,,|||}.||}{{||{}||{....||{((((((({(((.....))).))))))))))|||||||||,.|||.|,||||||||},,|,((({,((((({(,((..(,(({{{{||,,.{||{.,..{{{{{{||},,},)})),,||,|||{,,,.,)))).}})))),,).}))).,.}))))))),..))))))))}.}}}}|||,,||{({...{{{.,,,))),}}}}}..))},,,.({{{{..{.,..(((((.((((((......)}}}))).))))).,}..}}}}}.....,{{{{{{|,{{{,{,({((((,,,,|}}}||},||||}}}}||||.,,,|}|,,,,.,}}}}|||,,.,||{{|||....,,|,(((((((((((((((({.(((({({,,(((.{{.,.{{(({{.,{,{.....,}}.})),,},})}}.,)),))),...},,)}}}.}))))))))},)))))},||{|||||||||,||||{{...((((,..(((((((.{(((((,...{((..(((({....))))).))))))))}.})))))).}}}}...}}}|}|(((((({,..,,.|}}}}}}.}}}}.}})))))).{{((((((((..,.,{(({{{.....((((....))))...,}))))}}..)))))))))}....,.,,,,}})},,,...}}))}}}....))).{{{,{{{..,{|||}},,..|}},.}}}}),},}}}}}),))))}))))))))},})))))),.}}))})))))))))).))))).))),,.))))}.,,,,.....(((((((......)))))))(((((((.....)))))))..((((((({,((..,.,{.((.((((.(((((((((..,,{...(((((......((((((((.((.....)).))))))))...,.)))))....}},.))))))))).)))).)).},...,,.))))))))))...........,))).))))))))))(((((((,,.((..((((({....}))))).)).}.)))))))...(((((,{.(((((((.............)))))))..},.)))))..))))))))))))))...)))},((((((((...((((....(((.(.(.(((((((........))))).))).).)))..)))).)))))))),((((((((..(((((((({{....},....)))))))))))).))))))))).).))...))))))....,,,,....,,,||{{...}}},.)))))),...{((((.(((..,......,..)))))))}.((((((.((({{((,....,},).)))).)))))).(((((((.((((((....))))))))).)))).........(((({.(((((.....})))).}))}}....,,}.,||||,,.......})).)))|((((((((((((((((((....(((((((((((,,,{((((({..,(((...((((........))))...})})))))).,|||{{{.((({((,,,|}}|||{((((........)))){(((((({,.((({..{((((((((.........((((,(((.((((((..,,,,.((({({{{,,....,||||}}}}),}}|{{{......})},.{((.((((((((((.((((.((.((((((..(((.........)))..))))))}))))).)))))))))).))}.)))))))))...)))))))))))))))),,..))))))}........,{{,{(,{{.}||||{({{{{,,,,|.,},||,.,|||,..........,,..,,}|}},..,}}})}))),))))},)))))))))))...)))))).........))))))...))))))}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020755.4 NCBI
AAUCUCGGAAAGGCGAGAAAGAAGCUGUCUCCAUCUUGUCUGUAUCCGC… 3125 nt 0.3834
Summary

Predicted to enable acetyltransferase activator activity; enzyme binding activity; and protein-macromolecule adaptor activity. Predicted to be involved in membrane biogenesis; phosphatidylserine metabolic process; and sphingolipid metabolic process. Predicted to be located in endoplasmic reticulum membrane and plasma membrane. Predicted to be active in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.