Basic Information

Symbol
SERPINE2
RNA class
mRNA
Alias
Serpin Family E Member 2 PN1 GDN PNI PI7 Serpin Peptidase Inhibitor, Clade E (Nexin, Plasminogen Activator Inhibitor Type 1), Member 2 Peptidase Inhibitor 7 Glia-Derived Nexin Protease Nexin I Serpin E2 Nexin PI-7 PN-1 Serine (Or Cysteine) Proteinase Inhibitor, Clade E (Nexin, Plasminogen Activator Inhibitor Type 1), Member 2 Glial-Derived Neurite Promoting Factor Glial-Derived Nexin 1 Protease Nexin 1 GDNPF
Location (GRCh38)
2:223975045-224039688
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001136528.2
Sequence length
2226.0 nt
GC content
0.4573

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-640 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -682.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 561.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001136528.2 NCBI
GCGCUGUGGGGCUGCCCGGGCUGCGCGGCGUCUGCAGGCGCCACCGCUG… 2226 nt 0.4573
NM_001136530.1 NCBI
GUUACCUCUGCCUGGGCAGAGGGAGGUGACGCGCGGUGUGGGGAAAGCC… 2186 nt 0.4369
NM_006216.4 NCBI
GCGCUGUGGGGCUGCCCGGGCUGCGCGGCGUCUGCAGGCGCCACCGCUG… 2229 nt 0.4576
Summary

This gene encodes a member of the serpin family of proteins, a group of proteins that inhibit serine proteases. Thrombin, urokinase, plasmin and trypsin are among the proteases that this family member can inhibit. This gene is a susceptibility gene for chronic obstructive pulmonary disease and for emphysema. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2012]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the SERPINE2 as a shared upregulated differentially expressed gene in hypertrophic cardiomyopathy compared to adult human HCM [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4]. In a separate investigation, ultraviolet-B-induced inflammation in human and rat skin significantly upregulated the SERPINE2, with a fold change of 20.6 in human skin and 3.7 in rat skin, indicating its role in the inflammatory pain response [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].