Basic Information

Symbol
SETD3
RNA class
mRNA
Alias
SET Domain Containing 3, Actin N3(Tau)-Histidine Methyltransferase C14orf154 SET Domain Containing 3, Actin Histidine Methyltransferase Protein-L-Histidine N-Tele-Methyltransferase Actin-Histidine N-Methyltransferase SET Domain-Containing Protein 3 FLJ23027 HSETD3 Histone-Lysine N-Methyltransferase Setd3 Chromosome 14 Open Reading Frame 154 SET Domain Containing 3 EC 2.1.1.85
Location (GRCh38)
14:99395061-99480927
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032233.3
Sequence length
2856.0 nt
GC content
0.4510

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-856.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -913.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 838.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032233.3 NCBI
AGGCUGCCGUCCCGCCCCUCCCGUCCGGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCG… 2856 nt 0.4510
NM_199123.2 NCBI
AGGCUGCCGUCCCGCCCCUCCCGUCCGGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCG… 1401 nt 0.4918
Summary

Enables protein-L-histidine N-tele-methyltransferase activity. Involved in actin modification and peptidyl-histidine methylation. Located in cytoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human monozygotic twins demonstrated that the SETD3 is a target of miR-15b, which was validated as a biomarker associated with reduced physical function in activity of daily living strength scores [La Grotta et al. DOI:10.1016/j.mad.2025.112099].