Basic Information

Symbol
SFMBT2
RNA class
mRNA
Alias
Scm Like With Four Mbt Domains 2 KIAA1617 Scm-Related Gene Containing Four Mbt Domains 2 Scm-Like With Four MBT Domains Protein 2 Scm-Like With 4 MBT Domains Protein 2
Location (GRCh38)
10:7158624-7411488
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387889.1
Sequence length
8056.0 nt
GC content
0.4831

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2629.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2776.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2187.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001018039.1 NCBI
CGCCUUGUGUGUGCUGGAUCCUGCGCGGGUAGAUCCCCGAGUAAUUUUU… 7922 nt 0.4782
NM_001029880.3 NCBI
GGAUAAAGCGCAAGUUUGUGCACACGGUCGACUGAGCCAUUGGAAACCC… 8028 nt 0.4791
NM_001387889.1 NCBI
AUAUUGGAAUGAGCUGUAGUGGGAGCCGGAGGACCGGAGCGGGCGCGCG… 8056 nt 0.4831
NM_001387890.1 NCBI
AUAUUGGAAUGAGCUGUAGUGGGAGCCGGAGGACCGGAGCGGGCGCGCG… 7865 nt 0.4842
NM_001387891.1 NCBI
AGAGGAGCCAGAGGGAAAGCCAGCAAACGCGAGCUCGGGUAAUUUUUUC… 7920 nt 0.4780
Summary

Enables histone binding activity. Involved in negative regulation of gene expression. Located in aggresome; cytosol; and nuclear speck. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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