Basic Information

Symbol
SFRP2
RNA class
mRNA
Alias
Secreted Frizzled Related Protein 2 SARP1 FRP-2 SDF-5 Secreted Frizzled-Related Protein 2 SARP-1 SFRP-2 Secreted Apoptosis Related Protein 1 Secreted Apoptosis-Related Protein 1 Testicular Tissue Protein Li 170 FRP2
Location (GRCh38)
4:153780591-153789083
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003013.3
Sequence length
1996.0 nt
GC content
0.5165

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-628.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -667.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 460.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003013.3 NCBI
GCCCCAGCAACGGCUCAUUCUGCUCCCCCGGGUCGGAGCCCCCCGGAGC… 1996 nt 0.5165
Summary

This gene encodes a member of the SFRP family that contains a cysteine-rich domain homologous to the putative Wnt-binding site of Frizzled proteins. SFRPs act as soluble modulators of Wnt signaling. Methylation of this gene is a potential marker for the presence of colorectal cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human carotid atherosclerosis samples utilized the SFRP2 as a marker for manual annotation of NKT cell clusters during single-cell RNA sequencing analysis [Xue et al. DOI:10.3233/JAD-230559]. In a separate human ex vivo skin model of burn injuries, the SFRP2 was reported as a target of miR-218-5p, which enhances apoptosis, though this specific interaction was not experimentally studied within that paper [Foessl et al. DOI:10.3390/ijms22179209].