Basic Information

Symbol
SFRP4
RNA class
mRNA
Alias
Secreted Frizzled Related Protein 4 FrpHE Secreted Frizzled-Related Protein 4 FRZB-2 FRP-4 Frizzled Protein, Human Endometrium SFRP-4 Secreted Frizzled-Related Protein 4; Secreted Frizzled-Related Protein 4 FRPHE PYL
Location (GRCh38)
7:37905932-38025695
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003014.4
Sequence length
2868.0 nt
GC content
0.4557

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-858.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -911.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 956.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003014.4 NCBI
GGCUGCGCUCCGAGCUGCGGAGUCCGGGACUGGAGCUGCCCGGGCGGGU… 2868 nt 0.4557
Summary

Secreted frizzled-related protein 4 (SFRP4) is a member of the SFRP family that contains a cysteine-rich domain homologous to the putative Wnt-binding site of Frizzled proteins. SFRPs act as soluble modulators of Wnt signaling. The expression of SFRP4 in ventricular myocardium correlates with apoptosis related gene expression. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the SFRP4 was included as an mRNA marker for menstrual secretion identification in a targeted massively parallel sequencing panel, but all markers detecting the SFRP4 were removed during panel optimization [Neis et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2024.103125]. The SFRP4 was also mentioned as a menstrual blood-specific mRNA marker in a collaborative exercise evaluating RNA/DNA co-extraction for skin and contact trace identification [Haas et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2015.01.002].