Basic Information

Symbol
AXIN2
RNA class
mRNA
Alias
Axin 2 Conductin Axil Axis Inhibition Protein 2 Axin-Like Protein DKFZp781B0869 MGC126582 Axin-2 ODCRCS
Location (GRCh38)
17:65528561-65562067
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004655.4
Sequence length
4260.0 nt
GC content
0.5310

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1541.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1611.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 791.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363813.1 NCBI
GCGGCUGUGAUUGGCGCGGCGGGAUCACUGGCUCCGCGAGCCUGGCCCG… 4065 nt 0.5235
NM_004655.4 NCBI
GCGGCUGUGAUUGGCGCGGCGGGAUCACUGGCUCCGCGAGCCUGGCCCG… 4260 nt 0.5310
Summary

The Axin-related protein, Axin2, presumably plays an important role in the regulation of the stability of beta-catenin in the Wnt signaling pathway, like its rodent homologs, mouse conductin/rat axil. In mouse, conductin organizes a multiprotein complex of APC (adenomatous polyposis of the colon), beta-catenin, glycogen synthase kinase 3-beta, and conductin, which leads to the degradation of beta-catenin. Apparently, the deregulation of beta-catenin is an important event in the genesis of a number of malignancies. The AXIN2 gene has been mapped to 17q23-q24, a region that shows frequent loss of heterozygosity in breast cancer, neuroblastoma, and other tumors. Mutations in this gene have been associated with colorectal cancer with defective mismatch repair. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for AXIN2 Gene

Forensic Context

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