Basic Information

Symbol
SH2B2
RNA class
mRNA
Alias
SH2B Adaptor Protein 2 APS Adapter Protein With Pleckstrin Homology And Src Homology 2 Domains SH2 And PH Domain-Containing Adapter Protein APS SH2B Adapter Protein 2 Adaptor Protein With Pleckstrin Homology And Src
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001359228.2
Sequence length
2236.0 nt
GC content
0.7008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1097.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1135.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 341.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACUUCUUCCUCCCUGGGGAUGGAUCCAAGCUAUUGUCCUGCCCAUGGCU… 2127 nt 0.6822
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is expressed in B lymphocytes and contains pleckstrin homology and src homology 2 (SH2) domains. In Burkitt's lymphoma cell lines, it is tyrosine-phosphorylated in response to B cell receptor stimulation. Because it binds Shc independent of stimulation and Grb2 after stimulation, it appears to play a role in signal transduction from the receptor to the Shc/Grb2 pathway. [provided by RefSeq, Jun 2009]

Forensic Context

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