Basic Information

Symbol
SH2D1B
RNA class
mRNA
Alias
SH2 Domain Containing 1B EAT2 SH2 Domain-Containing Protein 1B EWS/FLI1-Activated Transcript 2 EAT-2 SH2 Domain-Containing Molecule EAT2
Location (GRCh38)
1:162395268-162412138
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_053282.5
Sequence length
2531.0 nt
GC content
0.4109

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-687.61 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -738.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 603.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_053282.5 NCBI
AGAGGAAGAGGUAGCUCCACAGGAGGUACAGCUGCUUACACAUCUCUCC… 2531 nt 0.4109
Summary

By binding phosphotyrosines through its free SRC (MIM 190090) homology-2 (SH2) domain, EAT2 regulates signal transduction through receptors expressed on the surface of antigen-presenting cells (Morra et al., 2001 [PubMed 11689425]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.