Basic Information

Symbol
AXL
RNA class
mRNA
Alias
AXL Receptor Tyrosine Kinase UFO JTK11 Tyro7 ARK Tyrosine-Protein Kinase Receptor UFO AXL Oncogene EC 2.7.10.1 AXL Transforming Sequence/Gene EC 2.7.10 AXL3
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_021913.5
Sequence length
4717.0 nt
GC content
0.5387

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1771.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1854.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1208.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCACACGCGUAAACAACACGCAGAACUGCAGUCGCACUUACAAGACUU… 4119 nt 0.5195
GAGAAGGCGGCUGCUGGGCAGAGCCGGUGGCAAGGGCCUCCCCUGCCGC… 4690 nt 0.5380
GAGAAGGCGGCUGCUGGGCAGAGCCGGUGGCAAGGGCCUCCCCUGCCGC… 4717 nt 0.5387
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the Tyro3-Axl-Mer (TAM) receptor tyrosine kinase subfamily. The encoded protein possesses an extracellular domain which is composed of two immunoglobulin-like motifs at the N-terminal, followed by two fibronectin type-III motifs. It transduces signals from the extracellular matrix into the cytoplasm by binding to the vitamin K-dependent protein growth arrest-specific 6 (Gas6). This gene may be involved in several cellular functions including growth, migration, aggregation and anti-inflammation in multiple cell types. The encoded protein acts as a host cell receptor for multiple viruses, including Marburg, Ebola and Lassa viruses and is a candidate receptor for the SARS-CoV2 virus. [provided by RefSeq, Sep 2021] CIViC Summary for AXL Gene

Forensic Context

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