Basic Information

Symbol
SHISAL2A
RNA class
mRNA
Alias
Shisa Like 2A FAM159A Family With Sequence Similarity 159 Member A Protein Shisa-Like-2A MGC52498 Family With Sequence Similarity 159, Member A Membrane Protein FAM159A WWLS2783 PRO7171
Location (GRCh38)
1:52633168-52669683
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001042693.3
Sequence length
924.0 nt
GC content
0.6569

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-394.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -410.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 199.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042693.3 NCBI
AGAGCCAGGCGAGCACGCGGCUCCCGGCCCAGCUCCCCGCGUCCGCUCC… 924 nt 0.6569
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans delineated age-associated mRNA expression patterns in peripheral blood from Chinese individuals and established a robust age prediction model using 34 candidate age-related genes, including the SHISAL2A which overlapped with genes previously reported in other studies [Liao et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2025.103373].