Basic Information

Symbol
SHKBP1
RNA class
mRNA
Alias
SH3KBP1 Binding Protein 1 PP203 Sb1 SH3KBP1-Binding Protein 1 SETA-Binding Protein 1 SB1
Location (GRCh38)
19:40576844-40591399
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138392.4
Sequence length
2341.0 nt
GC content
0.6232

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-999.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1036.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138392.4 NCBI
GCGGGCCAGCCGGCUCGCCCGGGGGCCAUGGCAGCAGCGGCUACUGCAG… 2341 nt 0.6232
Summary

Enables identical protein binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway. Predicted to be located in lysosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.