Basic Information

Symbol
SIRT1
RNA class
mRNA
Alias
Sirtuin 1 SIR2L1 NAD-Dependent Protein Deacetylase Sirtuin-1 NAD-Dependent Protein Deacylase Sirtuin-1 Regulatory Protein SIR2 Homolog 1 SIR2-Like Protein 1 Sirtuin (Silent Mating Type Information Regulation 2, S. Cerevisiae, Homolog) 1 Sirtuin (Silent Mating Type Information Regulation 2 Homolog) 1 (S. Cerevisiae) Sirtuin Type 1 EC 2.3.1.286 EC 2.3.1.- SIR2alpha HSIRT1 HSIR2 SIR2
Location (GRCh38)
10:67884656-67918390
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012238.5
Sequence length
4107.0 nt
GC content
0.4064

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1181.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1256.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1094.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142498.2 NCBI
GCAUCUCCUCCUCCCUCUCCCCGGGCUCCUACUGGCCUGAGGUUGAGGG… 3588 nt 0.3788
NM_001314049.2 NCBI
GCAUCUCCUCCUCCCUCUCCCCGGGCUCCUACUGGCCUGAGGUUGAGGG… 3949 nt 0.3781
NM_012238.5 NCBI
GCCAGUGCCGCGCGUCGAGCGGGAGCAGAGGAGGCGAGGGAGGAGGGCC… 4107 nt 0.4064
Summary

This gene encodes a member of the sirtuin family of proteins, homologs to the yeast Sir2 protein. Members of the sirtuin family are characterized by a sirtuin core domain and grouped into four classes. The functions of human sirtuins have not yet been determined; however, yeast sirtuin proteins are known to regulate epigenetic gene silencing and suppress recombination of rDNA. Studies suggest that the human sirtuins may function as intracellular regulatory proteins with mono-ADP-ribosyltransferase activity. The protein encoded by this gene is included in class I of the sirtuin family. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2008] CIViC Summary for SIRT1 Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that SIRT1 expression was significantly down-regulated in the subcutaneous adipose tissue of heavier co-twins from BMI-discordant monozygotic twin pairs [Jukarainen et al. DOI:10.1210/jc.2015-3095].