Basic Information

Symbol
SLAIN2
RNA class
mRNA
Alias
SLAIN Motif Family Member 2 KIAA1458 SLAIN Motif-Containing Protein 2 FLJ21611
Location (GRCh38)
4:48341472-48426201
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020846.2
Sequence length
6081.0 nt
GC content
0.3906

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1598.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1720.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1669.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_020846.2 NCBI
AAUCCCGGAGCCGGCGCAGAUGAGGCAGUUCGGCUGGGGCCAGCGGCGC… 6081 nt 0.3906
Summary

Involved in cytoplasmic microtubule organization; microtubule nucleation; and positive regulation of microtubule polymerization. Located in centrosome; cytosol; and microtubule plus-end. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the SLAIN2 as an mRNA marker for age estimation, demonstrating its expression decreases with age in dried blood stain RNA-Seq data [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976]. This marker was part of a lasso regression-selected gene list that achieved a mean absolute error of 4.46 years for age prediction in the primary dataset, establishing its utility in a forensic mRNA assay for predicting a biological stain donor's chronological age.