Basic Information

Symbol
SLC13A4
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 13 Member 4 SUT1 SUT-1 Solute Carrier Family 13 (Sodium/Sulphate Symporters), Member 4 Solute Carrier Family 13 (Sodium/Sulfate Symporter), Member 4 Na(+)/Sulfate Cotransporter SUT-1 Sulphate Transporter 1 Solute Carrier Family 13 (Sodium/Sulfate Symporters), Member 4 NAS2 NaS2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001318192.2
Sequence length
2906.0 nt
GC content
0.5358

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-995.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1048.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 588.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((..(((....)))))))))).........((((.............((.((((((((((................))))).((((......)))).((((((.(((.(((...(((.(((.(.((((.....)))))))).)))))).)))...))))))......))))).))((((((((..((((((((((((.......(((((((((((.....(((..((((.((((((...(((((((((((((((...)))))))(((((((...)))))))....((((.....(((.....)))))))(((.((((((((((...((.(((((((..(((....((.((....)).))....)))......))))))).)).........((.(((..(((.(((((((...((((........((.((((((((.((((((((((((((((.(((.......(((((.((.((((........(((((((((..((...)).))))))))).........(((((((....))))))).((((.((....)).)))).(((((((((.((..(((((......)))))..))))))))))))))).)))))))))).))).))))))))((((.(.(((......))).)...))))..)))))))))))))..))))))...))))))).)).)..))).)).((((....)))).)))))))))).)))..((((((((.((((.((.((((((..(((..(.((((((((.((((((((.((..(((.((((....)))))))..(((((....)).))).(((((..((((((.(((((...(((........))).)))))..))))))...)))))((((((.(((((.(((((.((((......))).).))))).))))))))))).)).))))))))..)))))))).)....))).)))))).))...))))..).)))...))))...(((((......)))))..((((((..(((..((((....(((.(.((((..(((((((..(((((.((((((.((((.(((.((((.(((..((((.((((.......((.((((.....)))).)).......)))))))))))..)))).))))))))))))))))))..))))))).)))).).)))..))))....)))..))))))....)))))))).(((.(((.....))).))).)))))).)))))))......((((......))))((((.......))))((((((.(((((((.((..............(((((..(....)..)))))...((((((...((.....((((...((((((.....((......((.((((((((.(((((...((((.((...(((((.(((...((((((((((((..(((.....(((((.(((...((.((.((((((......((((.((.....))))))........((((((....))))))..........))))))))))....(((((.((((......(((((..(((.........))).))))).....))))))))).....))).))))).....)))))))))))................))))..)))...))))).)).))))....))))).)))))))).)).........(((((.....)))))(((.((((.((.((((.(((..((((((((((((((((.((((((((((((.......(((......(((((((.(....))).)))))..))).....)))).))))))))...))))))))...((((((((.....(((.(((((..(((((((((.....)))))...........))))..))))).))).......))))))))...))).)))))))))))).)).)))).)))......))......))))))..)))).....))..)))))).((...((((((((..((...(((((....((((((((((((...(((((((..(((((((((.((.((...))..)).))).))))))..)((((((((((.(((((.(((......))).)))))..))))))))))(((((((((((((..(((..........(((.((((((........)))))))))...((((((..(((.((((((((........))).))).....)))))..)))))).........................((((((((...........)))))))).................))).)))))))..)))))).....))))))...))))))......))))))..))))).....(((((.(((((......(((......))).....))))))))))))..)))..)))))...))...))))))))).)))))).......((((........))))))))))))..)))))))))))))))..........((((((((((.(((((.......((.(((......((((..((((.((......))))))((.......))...((((.((.(((((......)))))..)).))))...........)))).....))))).............))))).))))((((((...))))))....((.(((((((((((.....)))....)).)))))).))...............))))))))))))))..(((((((((.........(((......)))...((((........))))......((((...)))).........................................))))))))).......))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((..(((....)))))))))).........((((....,....,,,{({.,{({((((((..,.,,.,,.,{{,..,,},}.{(((,.,,..}}}}.{|||||,|||.||,,.,|||,|{,.|,{{((..,,,}}}}}})),)))},,.|||...|||||}.,,...}}}}}.},((((((((,.((((((((((({......,(((((((((((.....(((..((({,((((((...(((((((((((((((...)))))))(((((({...}))))}}....||{{,.,,.,{,.....}|}||||(((.((((((((((..{(({(((((,,..{{{,.,....,,,,}}}}})).))})))..,.,,,|||,,,,}}....,,...{{.(((..{((.(((((((...((((,,.,.......(((((({({((((((((((((((((.(((.......(((((.((.{(((........(((((((((..((...)).))))))))).,...,.|.(((((((....)))))))|(((({({.......}}}}.(((((((((.((..(((((......)))))..))))))))))))))}.)))))))))).))},))))))))||||,{.((|,,.,.}))),|{{.,,,)}}))))))))))))),.),))}),}.))))))).)).}..))).}}.((((....)))).)))))))))).))),,{(((({(({((((,((.((((((.,{((..(.((((((((.((((((((.((...{{.({{{.||||,}}....,||||,.,,.},}}}}.(((((..((((((.(((((...(((.{{....})))})))))..))))))}..)))))((((((.(((((.(((((.((((......))).).))))).))))))))))).)).))))))))..)))))))).,....))).)))))).)).,,))))..)})),,,.,))}...(((((......)))))..((((((..{((..((((....(((.(.((((..(((((((..(((((.((((((.((((.(((.((((.{{{,{(({{.({{{.......((,((((....|)))).}}......,))))))}))))..)))).))))))))))))))))))..))))))).)))).).)))..))))....))}..)))))),...)))))))).(((.(((.....))).))).})))))})))),,,..,,,.((((......)))}((((.......)))){(((((.(((((((..,,{{,,,.....,..(((((..(....)..))))}...((((((...((.....((((...((((((.....{{......{{.((((((((.(((((...((((,((,,.(((((.,{{{{,{(,,(((((((({.((,.....(((((.(((...{{.{(.(({{{{,,|...((({{((.....))))))........((((((....))))))..,|......})))}}))),....(((({,((((......(((((..{{{.........})).)))))..,..))))))))).....))).)))))..,.,)})))))))))......,,,.......,)))}},)),}})}}}}.,,.))))....))))).)))))))).)).........(((({.....))))|(((.((((.((.((((.(((..{(((((({((((((((,((((((((((({.,.....(((......(((((((.{....})).)))))..,},,}..}))))))))))))).,.)))))))).|.((((((((,{,..(((.{((((..(((((((((.....)))))...........))))..))))}.)))...,,,.)))))))),..})).)))))))))))).)).)))).))),.....},,.....))))))..)))).....))..)))))).|,...((((({((,.{{.,{((((,....{{(((({{{{{{,|||{{{({{..{{{({{{{{.,|,||,,,)}..,,.})).))))}),,)((((((((((.(((((.(((......))).)))))..)))))))))),,,,((((((((,...(((((.{{....{({,((((((.,....,.))))))))}...((((((..(((,{{((((((.,....,.))).)))..,,,)})))..)))))).....,}.})))}.....}}}}}}}((((((((.,.......,.))))))))............,,...,||,|}||||||,||||||.....}}}}}},|,||}}}}..,...}}})))..}}})).....|||{{.{{{{,..},..{||,},,,})}),....,,})))))))))..}))..})))),..))...))))))))).)))))).......((((........))))))))))))..)))))))))))))))..........((((((((((.(((((.{,....,,.,,}.....||,,...(((,,((......)))))){{.......))...((((.{{.(((((......)))))..}}.)))}.......,,..,.||....,}.||.,.........,..))))).))))((((((...))))))....((.(((((((((({.,,..}}),...)).)))))).))...............)))))))))))))).}||{|||{||,,|.,.,,,|||......))}...{,.,.{{{,..||||,......|||{..,)))).........................................,}}}}}}},.......))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CUGCUUUGCAGGCCCAGGCUCAAGGCAAAUUAUAAGUAGGGAACCAAUU… 2906 nt 0.5358
CUGCUUUGCAGGCCCAGGCUCAAGGCAAAUUAUAAGUAGGGAACCAAUU… 2903 nt 0.5357
Summary

Enables sodium:sulfate symporter activity. Predicted to be involved in transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients identified the SLC13A4 as one of the top five downregulated mRNAs in brain contusion tissues compared to adjacent tissues, with a log2(fold change) of -5.13202 [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756].