Basic Information

Symbol
SLC16A10
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 16 Member 10 MCT10 TAT1 Solute Carrier Family 16 (Monocarboxylic Acid Transporters), Member 10 Solute Carrier Family 16 (Aromatic Amino Acid Transporter), Member 10 Aromatic Amino Acid Transporter 1 T-Type Amino Acid Transporter 1 Monocarboxylate Transporter 10 MCT 10 Solute Carrier Family 16, Member 10 (Aromatic Amino Acid Transporter) PRO0813
Location (GRCh38)
6:111087503-111231194
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018593.5
Sequence length
10757.0 nt
GC content
0.3977

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3246.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3445.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2830.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018593.5 NCBI
AGUCGGGGGUGCGGGGCUGUGACCUAGAGGCUUCAGUGUCGAUCCCCGA… 10757 nt 0.3977
Summary

SLC16A10 is a member of a family of plasma membrane amino acid transporters that mediate the Na(+)-independent transport of aromatic amino acids across the plasma membrane.[supplied by OMIM, Apr 2004]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the SLC16A10 is an mRNA marker down-regulated with increasing age in blood, identified via microarray and validated by TaqMan qPCR [Zubakov et al. DOI:10.1016/J.Fsigen.2016.05.014]. This biomarker was included among nine mRNA biomarkers used in an age prediction model combining RNA and other biomarkers for donor age estimation [Haas et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2021.102486].