Basic Information

Symbol
B3GAT1
RNA class
mRNA
Alias
Beta-1,3-Glucuronyltransferase 1 Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-Beta-Glucuronosyltransferase 1 Glucuronosyltransferase P GlcAT-P UDP-GlcUA:Glycoprotein Beta-1,3-Glucuronyltransferase EC 2.4.1.135 GLCATP CD57 LEU7 CD57 Antigen LEU7 Antigen GlcUAT-P GLCUATP HNK1 NK-1 NK1
Location (GRCh38)
11:134378504-134412242
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_054025.3
Sequence length
3976.0 nt
GC content
0.6205

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1741.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1806.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1074.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001367973.1 NCBI
AGAGCCGCGGCGGCACCGGCGCAUCCGCCGCCACCUCGGGGACUCUGCG… 3827 nt 0.6198
NM_018644.3 NCBI
GGAGGGAGCCGCACGCGGCCCAGGGCAGCGGUCUAGGGGCGCCGGGGCC… 3534 nt 0.5959
NM_054025.3 NCBI
AGAGCCGCGGCGGCACCGGCGCAUCCGCCGCCACCUCGGGGACUCUGCG… 3976 nt 0.6205
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the glucuronyltransferase gene family. These enzymes exhibit strict acceptor specificity, recognizing nonreducing terminal sugars and their anomeric linkages. This gene product functions as the key enzyme in a glucuronyl transfer reaction during the biosynthesis of the carbohydrate epitope HNK-1 (human natural killer-1, also known as CD57 and LEU7). Alternate transcriptional splice variants have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing leukocyte gene expression profiles from severe burn patients identified the B3GAT1 as a top sustained increasing gene (SIG) with expression that rises from the healthy state through the late recovery phase (>400 hours post-injury), classifying it as a biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].