Basic Information

Symbol
SLC23A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 23 Member 1 YSPL3 SVCT1 Solute Carrier Family 23 (Ascorbic Acid Transporter), Member 1 Solute Carrier Family 23 (Nucleobase Transporters), Member 2 Na(+)/L-Ascorbic Acid Transporter 1 Yolk Sac Permease-Like Molecule 3 SLC23A2 HSVCT1 Solute Carrier Family 23 (Nucleobase Transporters), Member 1 Sodium-Dependent Vitamin C Transporter-1 Sodium-Dependent Vitamin C Transporter 1
Location (GRCh38)
5:139367196-139385495
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005847.5
Sequence length
2296.0 nt
GC content
0.5314

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-798.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -838.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 547.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005847.5 NCBI
AUCCCCUCUUCUCCUCAGGAACUGCUCAAACCUGUGCCCCAAAGAUGAG… 2296 nt 0.5314
NM_152685.4 NCBI
AUCCCCUCUUCUCCUCAGGAACUGCUCAAACCUGUGCCCCAAAGAUGAG… 2308 nt 0.5312
Summary

The absorption of vitamin C into the body and its distribution to organs requires two sodium-dependent vitamin C transporters. This gene encodes one of the two transporters. The encoded protein is active in bulk vitamin C transport involving epithelial surfaces. Previously, this gene had an official symbol of SLC23A2. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.