Basic Information

Symbol
SLC23A2
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 23 Member 2 SVCT2 YSPL2 KIAA0238 SLC23A1 Solute Carrier Family 23 (Ascorbic Acid Transporter), Member 2 Solute Carrier Family 23 (Nucleobase Transporters), Member 1 Nucleobase Transporter-Like 1 Protein Na(+)/L-Ascorbic Acid Transporter 2 Yolk Sac Permease-Like Molecule 2 NBTL1 Solute Carrier Family 23 (Nucleobase Transporters), Member 2 Sodium-Dependent Vitamin C Transporter-2 Sodium-Dependent Vitamin C Transporter 2 Testicular Secretory Protein Li 48 HSVCT2
Location (GRCh38)
20:4851729-5010293
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005116.6
Sequence length
6953.0 nt
GC content
0.4924

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2357.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2483.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1946.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_005116.6 NCBI
GCCAUUUUGCAGGCGGCUGUCGCGGGGACCGGAGGCGGAGGCUGCAGCG… 6953 nt 0.4924
NM_203327.2 NCBI
ACCCUCUUCUGGAGCAGGGCCAUUCAUCUUCUCCUGCCCUUGGACAUCA… 6980 nt 0.4897
Summary

The absorption of vitamin C into the body and its distribution to organs requires two sodium-dependent vitamin C transporters. This gene encodes one of the two required transporters and the encoded protein accounts for tissue-specific uptake of vitamin C. Previously, this gene had an official symbol of SLC23A1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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