Basic Information

Symbol
SLC24A5
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 24 Member 5 NCKX5 JSX OCA6 Solute Carrier Family 24 (Sodium/Potassium/Calcium Exchanger), Member 5 Oculocutaneous Albinism 6 (Autosomal Recessive) Sodium/Potassium/Calcium Exchanger 5 Na(+)/K(+)/Ca(2+)-Exchange Protein 5 Na/Ca-K Exchanger 5 Solute Carrier Family 24, Member 5 Ion Transporter JSX SHEP4
Location (GRCh38)
15:48120990-48142672
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_205850.3
Sequence length
1879.0 nt
GC content
0.3938

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-480.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -519.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 523.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_205850.3 NCBI
AAUCCUCCUCUUCUCCCUUCCUGAAGCUGCACGCUGCAGUAAGAGCACA… 1879 nt 0.3938
Summary

This gene is a member of the potassium-dependent sodium/calcium exchanger family and encodes an intracellular membrane protein with 2 large hydrophilic loops and 2 sets of multiple transmembrane-spanning segments. Sequence variation in this gene has been associated with differences in skin pigmentation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.