Basic Information

Symbol
B4GAT1
RNA class
mRNA
Alias
Beta-1,4-Glucuronyltransferase 1 IGnT N-Acetyllactosaminide Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase UDP-GlcNAc:BetaGal Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase 1 BETA3GNTI B3GN-T1 B3GNT1 B3GNT6 IGAT UDP-GlcNAc:BetaGal Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase 6 I-Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase Poly-N-Acetyllactosamine Extension Enzyme Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase BGnT-6 EC 2.4.1.149 EC 2.4.1.- MDDGA13
Location (GRCh38)
11:66345374-66347638
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006876.3
Sequence length
2007.0 nt
GC content
0.5700

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-815.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -852.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 599.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006876.3 NCBI
AGGCUGCGGUAAAUCCGGGCUUGCGGCCGCUGGCGUAGUCUGUGGCCGG… 2007 nt 0.5700
Summary

This gene encodes a member of the beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase family. This enzyme is a type II transmembrane protein. It is essential for the synthesis of poly-N-acetyllactosamine, a determinant for the blood group i antigen. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that acute alcohol exposure during neurulation down-regulated the B4GAT1 gene (-0.17 Log2FC) in the rostroventral neural tube at 2 hours, an expression change associated with hypoplasia of the brain stem [Boschen et al. DOI:10.1016/J.Alcohol.2022.09.001].