Basic Information

Symbol
SLC25A26
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 25 Member 26 SAMC Solute Carrier Family 25 (Mitochondrial Carrier; Phosphate Carrier), Member 26 Solute Carrier Family 25 (S-Adenosylmethionine Carrier), Member 26 S-Adenosylmethionine Mitochondrial Carrier Protein Mitochondrial S-Adenosylmethionine Carrier Protein SAM Carrier Mitochondrial S-Adenosylmethionine Transporter COXPD28
Location (GRCh38)
3:66133610-66388116
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001379210.1
Sequence length
2035.0 nt
GC content
0.4639

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-649.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -687.7 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 666.8
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164796.1 NCBI
UUCAGAAUCACGCCGGCCUCAUUCUACCGCUGCUCUCUCCUGGAUCUCG… 2154 nt 0.4777
NM_001350993.1 NCBI
UUCAGAAUCACGCCGGCCUCAUUCUACCGCUGCUCUCUCCUGGAUCUCG… 2385 nt 0.4809
NM_001379210.1 NCBI
AGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGC… 2035 nt 0.4639
NM_001400705.1 NCBI
AGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGC… 2247 nt 0.4677
NM_001400707.1 NCBI
AGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGC… 1990 nt 0.4658
NM_001400709.1 NCBI
AGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGC… 2090 nt 0.4689
NM_001400711.1 NCBI
AUUCUACCGCUGCUCUCUCCUGGAUCUCGGCCACGGAUCUUUUGCUCGC… 2005 nt 0.4559
NM_001400714.1 NCBI
AGACCCGCCUCAAACAUGGCGGCGCCCAGCGCGCGAGGACGUGAUCCGC… 1833 nt 0.4670
NM_173471.4 NCBI
AACCUGAAGCUCUCAGAGCUUCCCUGUCUUCAUCUAUCAGCCCAGGGAG… 2669 nt 0.4743
Summary

This gene is a member of the mitochondrial carrier family which includes nuclear-encoded transporters localized on the inner mitochondrial membranes. Members of the family transport important small molecules across the mitochondrial inner membrane. This protein is involved in the transport of S-adenosylmethionine (SAM) into the mitochondria. Mutations in this gene are associated with combined oxidative phosphorylation deficiency 28. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Apr 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.