Basic Information

Symbol
SLC26A11
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 26 Member 11 Solute Carrier Family 26 (Anion Exchanger), Member 11 Sodium-Independent Sulfate Anion Transporter Solute Carrier Family 26, Member 11
Location (GRCh38)
17:80219699-80253509
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001166347.2
Sequence length
2888.0 nt
GC content
0.6035

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1221.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1264.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 811.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166347.2 NCBI
CUGUCCCCGGCGAUUCCUGCGGACCCAGCUGCGGCGACGCCAGGAGACC… 2888 nt 0.6035
NM_001166348.2 NCBI
CUGUCCCCGGCGAUUCCUGCGGACCCAGCUGCGGCGACGCCAGGAGACC… 2818 nt 0.5997
NM_001166349.2 NCBI
CUGUCCCCGGCGAUUCCUGCGGACCCAGCUGCGGCGACGCCAGGAGACC… 2688 nt 0.5971
NM_173626.4 NCBI
CUGUCCCCGGCGAUUCCUGCGGACCCAGCUGCGGCGACGCCAGGAGACC… 2885 nt 0.6038
Summary

This gene encodes a member of the solute linked carrier 26 family of anion exchangers. Members of this family of proteins are essential for numerous cellular functions including homeostasis and intracellular electrolyte balance. The encoded protein is a sodium independent sulfate transporter that is sensitive to the anion exchanger inhibitor 4,4'-diisothiocyanostilbene-2,2'-disulfonic acid. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in the forensically important flesh fly *Sarcophaga peregrina* demonstrated that the SLC26A11 was consistently up-regulated during postembryonic development from larval to pupal stages, a pattern validated by qRT-PCR [Ren et al. DOI:10.3390/insects13050453].