Basic Information

Symbol
SLC27A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 27 Member 1 ACSVL5 FATP1 FATP Solute Carrier Family 27 (Fatty Acid Transporter), Member 1 Long-Chain Fatty Acid Transport Protein 1 Very Long-Chain Acyl-CoA Synthetase Long-Chain-Fatty-Acid--CoA Ligase Fatty Acid Transport Protein 1 Arachidonate--CoA Ligase MGC71751 FLJ00336 FATP-1 EC 6.2.1.15 EC 6.2.1.3 EC 6.2.1.- EC 6.2.1
Location (GRCh38)
19:17467666-17506190
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_198580.3
Sequence length
3514.0 nt
GC content
0.6283

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1559.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1616.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 926.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((((((((.(((((((((((((((.((((.((((.....)))).)))).)))).(((((.(((((....((((((.((((...(((((((((..(((((.(.(((.((((((((((((((((((((...((((.....)))).))))).(((((((((.((((.....))))..))))))...))))))).))))))))))))))).)))))((((((((....))))).)))........)))))).)))))))))))))...))))).)))))(((.(((((((((((.(((....)))(((.(((((....))))).)))..((.(((((((.((...........((....))..........))))))))).))...)))))))))).).)))(((((.(((....))).))))).)))))))))))((((.(((.((((((((((.(...).)))))..((.(((((((((((.............)))))))).))))).((((((.((((((((...))))))))..)))))).........((((((.(.((((.(((((((((((((((((((.(((((((...(((((.((((((..((((((...))).)))))))))(((((((..(((((((..((((((...(...(((((((((((..((((.((((.(((.......))).))))))))......(((((....((((.(((((.(.((((.((((.((((.....(((.((.....)).))).(((.(((((((((((.((.((((.......)))).))...))))))))))).)))..(((((((....((((((((....))).)))))...((((...((((((............)))))).....)))).)))))))(((((.(((((.((((((.(((((((((((((((.....((((.....(((....))).))))))))))))))((((..(((....)))..))))..))))).))).)))))))))))))((.(((.((((...)))).)))))((.(((((.....(((....)))...))))).)))))).)))).)))).))))))))))..))))).)).))))).)))).).))))))((((......((((((.(((....))).)).))))))))..((((((((...(((...(((..((((.((((((((..((......))..))))).))).))))))).((((.((.(((..((((......)))).))).))))))..)))...))))))))))))))).)))))))....)))))))))((((((((...))))))))....(((((((..............)))))))..)))))))))..((((.((((...((((((.(((((((((..(((((.(((.....)))))))).....(((((....)))))((((...)))).....(((((((..(((((..((((((...(((((((((((((((((((((((((.....)))))))...(((((((((....(((((((.....)))))))((((.((...))))))....((((((((((((((....)))))..(((((((.......(((((((((((..(((((((((((((.(((((..((((...........))))))).)))))...........((((((.(((((((((((((((((.....)).)))))..))))).))))).))))))....((((((((((....(((((((((........)))).((((((.((((.(((.(((((((((......((((..(((((.((((((((.((((........)))).)))))).....((((((......).))))).........((....))..(((((....)))))..(.((((((.(((((((((((((.((.....)))))).))).)))).)).)))))).)((((((((((.(.(((..((((((.............))))).)..))).).)))))..)))))..((.....)).)).)))))...))))....))))))...)))....))).)))).)))))))))))...))))))))))....))))))))))....)))))).))))).))))))).......)))))))))....))))))))).....................((((........))))((((((...))))))....(((((((((((.((...(((((((....((.(((((..((((((........))))))..))))).)))))))))(((((((......((((((((......(((....)))......)))))))).(((((((.......))))))).(.((..(((((.((..(((((((..(........).))))))).))))))).)).).(((....)))((((((....))))))....)))).))))))))))))))))..............(((.(((((.....))))).)))....))).)))))))))).)))))...(((((((((((((.......(((((((.((((((...(((((((((((.(((((((...(((.(((((...)))))..))).))).(((...)))....(((((((.(((...((((......))))))))))))))...((((((..((((.((((...((((.(((((..(((((........(((((((((((((((.(((((.......((((..((((........))))....))))...(((.....)))..)))))))))))((((((.................((...(((.((.((.......)).)).)))...)).)))))).....((((((((.....(.(((...))))..)))))))))))))))))........)))))..)))))))))(((((((.......((((.((.(((((....))))))).(((((((........)))))))...(((((((....))))))).)))).......)))))))))))))))..)))))).)))).))))))))))).))))))((((((..((((.((...(((...(((((..((..(....)..)).)))))....))))).))))))))))..))))))))))..)))))).))))(((.(((((((.((((((...))).)))))))))).))))))))).))))).)))))))...))))))))).).))))).))))....))))(((((...))))).)))))))...))))))...)))).).))))))..))))).))).))))(((((((.........)))))))(.(((.(((((........))))).))).)....)))))))......(((((.(((((.(((.....))).)))))))))).))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
......,(,{{(((((((.(((((((((((((((.((((.((((.....)))).)))).)))).(((((.(((((....((((((,{|{{,,,(({((((((..(((((.{{(((.((((((((((((((((((((...((((.....)))).,}||||{{.{{{{{|,{{((.{{{{||,,..,))))),.,},})))).))))))))))))))).)))))((((((((....)))))},))........)))))).}}|}}}}})))))||,))))).)))))(((.(((((((((((.(((....)))(((.(((((....))))).))}..((.(((((((.((.{{{{{.....|,}}}}),..........))))))))).))...)))))))))).).)))(((((.(((....))).))))|.)))))))))))((((.(((.((((((.{{((((,{(({((((..((.(((((((((((.............)))))))).))))).,||}}..,)))}})})..,{{((({,{.,,,)))}.,,.....((((((.(.((((.(((((((((((((({{(((.(((((((...(((((..,{,,,..,{{{({|{|.|},})}))))))|((((((..((((({{,||||((,...|}..(((((((({({..{(((,{{((.(((.......))),)))))))}}.,...|{{{{....((({.(((((.,.(({{.{{{{.{{{{.....(((,((.....)),)}).(((.(((((((((((.((.((((.,....,)))).))...))))))))))).))),.(((((((....((((((((....))).)))))...{{{{.|,((((((..,{,.......)))))).....}}}}.)))))))(((((.(((((.{(,(((.{((((((((((((((..,..(({,.....{((....))).}))}))))))))))((((..(({....}))..))))..))))}.))).)),))))))))))((,(((.((((...)))).))))}{{.(((({,|.,,(({...,))).),))))).)))))),})}}.)))).})))))))))..))))),)).))})}.)))}|||}}}||}|,,|||,...{{((((.(({....})),}).))))||||..{{((((({,,{((,...,{|..(((|.(({(((((.,{(,,,...}}.,))))),}}}}))))|||.((({.((.(({..((((,.....)))}.})).))))))..})).}|}}},)))))))))}}.}}}})}}.,,.))))}}}}}((((((((...))))))))....(((((((..............))))))).,)))})))))..((((.{(({...((((({.(((((((((..(((((.(((.....)))))))).....{((((....))))|((((...))))}....(((((((..((((({{(((((({,,(((((((((((((((((((((((((.....})))))),..(((((((((....(((((((.....)))))))((((.((...))))))....((((((((((((((....}}}},..(((((((.......(((((((((((.,(((((((((((((.(((((..((((.........,.))))})).)))))...........((((((.(((((((((((((((((.....))))})))..))))),})))).))))))....((((((((((.,..(((((((((..,.,,,,||||,{(((((,({{(.(((.((({{{{{,.....,||||.,|||{{..,{{{{{{,|||{.,,,,..,)))}.|||}}}.....{{||{{......|,|||||.........((..,,||,,(((((....)))))..,.((((((.{((((((((((((.((.....)))))).)))})})),)).)))))),))||||(((((.{.({({{((((((...,,...|,...))))}.,,,))).}.)))))..,,|||{{{{....{|||,,.|||||...,,,,...}))))))}}.,))}}}})}}.}})),)))))))))))..,))))))))))....))))))))))..,.)))))).))))).))))))).....,))))))))))....))))))))).....................{{{{........)))){(((((...})))))..{.(((((((((((.((...(((((((....((.(((((..((((((........))))))..))))).)))))))))(((({{,.}}}|.((((((((......(((....)))......)))))))).{{{{{{{.......))))})}{({{(..(((((.((..(((((((..(,,.....,),))))))).))))))).}).},{((....))}((((((....))))))....}))).}},)))))))))))))}.........,{{{{((,{((,,.....))))).))),...))).)))))))))).))))}...||||||||}|||}}}{,,..(((((((.((((((...(((((((((((.(((({({...(({.(((((...)))))..))).,,,.(((...)))....(((({{{{(({...((((......))))))))))))))...{(((((..((((.((((...(((,{(((((..(((((........(((((((((((((({,(((({.......((((..((((........))))....))))...{((.....))}..,))))))))))((((((.,,,...,{.........,...{((.({.((.......)).)).)))...}}.)))))).....((((((((.....{.{{{...}}),..)))))))))))))))))........)))))..)))))))))(((((((......,(((({{.{{((,{((((((...({{.((((((.....})}))),)))...))))))}.}},},},|))})),......,.)))))))))))))))..)))))),)))).))))))))))).))))))((((((..((((.({...(((...(((((..,,..,....)..,,.)))))....))))).))))))))))..))))))),.,..)))||||.,,|(((.(((((((.((((((...)))},))))))))).))))}}))),))))).))))))).,,))))))))).}.))))).}))}...,)))){|{{....))))).)))))))...))))))...)))).).)))))).|))))).))).)))}{((((((.........))))))}(.(((.(((((.{....,.))))).))).}....)))))))......(((((((((((.(((.....))).)))))))))).},))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_198580.3 NCBI
CUCUCUGCUUCCCCAGGAUGCGGGCUCCGGGUGCGGGCGCGGCCUCGGU… 3514 nt 0.6283
Summary

Enables biotin transmembrane transporter activity; efflux transmembrane transporter activity; and long-chain fatty acid transmembrane transporter activity. Involved in export across plasma membrane; lipid transport across blood-brain barrier; and monocarboxylic acid transport. Located in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.