Basic Information
Symbol
SLC29A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 29 Member 1 (Augustine Blood Group)
ENT1
Solute Carrier Family 29 (Equilibrative Nucleoside Transporter), Member 1
Equilibrative Nucleoside Transporter 1
Nucleoside Transporter, Es-Type
Es Nucleoside Transporter
HENT1
Equilibrative Nitrobenzylmercaptopurine Riboside (NBMPR)-Sensitive Nucleoside Transporter
Equilibrative Nitrobenzylmercaptopurine Riboside-Sensitive Nucleoside Transporter
Solute Carrier Family 29 (Nucleoside Transporters), Member 1
Equilibrative NBMPR-Sensitive Nucleoside Transporter
Solute Carrier Family 29 Member 1
AUG
Location (GRCh38)
6:44219245-44236432
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_001372327.1
Sequence length
2083.0 nt
GC content
0.5540
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-765.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-803.16 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
449.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGCGAGAGCGCGCGGAUCUCAGCGCGGGAGCAGUGCUUCUGCGGCAGGA… | 2190 nt | 0.5584 | |
| AGCGAGAGCGCGCGGAUCUCAGCGCGGGAGCAGUGCUUCUGCGGCAGGU… | 2507 nt | 0.5840 | |
| CUCUCUUCCGCCCGGCGGCCCACACCGGUCAGGCCCGGCGCGGGCUGCG… | 2304 nt | 0.5621 | |
| CUCUCUUCCGCCCGGCGGCCCACACCGGUCAGGCCCGGCGCGGGCUGCG… | 2207 nt | 0.5609 | |
| CUCUCUUCCGCCCGGCGGCCCACACCGGUCAGGCCCGGCGCGGGCUGCG… | 2204 nt | 0.5608 | |
| AGCGAGAGCGCGCGGAUCUCAGCGCGGGAGCAGUGCUUCUGCGGCAGGC… | 2083 nt | 0.5540 |
Summary
This gene is a member of the equilibrative nucleoside transporter family. The gene encodes a transmembrane glycoprotein that localizes to the plasma and mitochondrial membranes and mediates the cellular uptake of nucleosides from the surrounding medium. The protein is categorized as an equilibrative (as opposed to concentrative) transporter that is sensitive to inhibition by nitrobenzylthioinosine (NBMPR). Nucleoside transporters are required for nucleotide synthesis in cells that lack de novo nucleoside synthesis pathways, and are also necessary for the uptake of cytotoxic nucleosides used for cancer and viral chemotherapies. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for SLC29A1 Gene
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.