Basic Information

Symbol
SLC31A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 31 Member 1 CTR1 HCTR1 COPT1 Solute Carrier Family 31 (Copper Transporter), Member 1 High Affinity Copper Uptake Protein 1 Copper Transporter 1 Solute Carrier Family 31 (Copper Transporters), Member 1 Copper Transport 1 Homolog (S. Cerevisiae) Copper Transport 1 Homolog NSCT
Location (GRCh38)
9:113221191-113264492
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001859.4
Sequence length
4762.0 nt
GC content
0.4408

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1469.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1560.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1038.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001859.4 NCBI
AAAUCCUCGGCCUCGGUGGCGGUGGUGGACACGUCGAGCCGGGUAGAAG… 4762 nt 0.4408
Summary

The protein encoded by this gene is a high-affinity copper transporter found in the cell membrane. The encoded protein functions as a homotrimer to effect the uptake of dietary copper. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

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