Basic Information

Symbol
SLC34A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 34 Member 1 SLC17A2 NAPI-3 NPTIIa SLC11 NPT2 Solute Carrier Family 34 (Type II Sodium/Phosphate Cotransporter), Member 1 Solute Carrier Family 17 (Sodium Phosphate), Member 2 Solute Carrier Family 34 (Sodium Phosphate), Member 1 Sodium-Dependent Phosphate Transport Protein 2A Na(+)-Dependent Phosphate Cotransporter 2A Sodium-Phosphate Transport Protein 2A Na+-Phosphate Cotransporter Type II Sodium/Phosphate Cotransporter 2A Sodium/Phosphate Co-Transporter Na(+)/Pi Cotransporter 2A NaPi-2a Renal Sodium-Dependent Phosphate Transporter NPHLOP1 HCINF2 NaPi-3 FRTS2
Location (GRCh38)
5:177379235-177398848
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003052.5
Sequence length
2583.0 nt
GC content
0.5978

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1090 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1132.4 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 775.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001167579.2 NCBI
GUCCUGGAGGCUUCAUUGAGCUGCUGAGCAGAAGCUGAAACACAGAAUU… 1912 nt 0.5837
NM_003052.5 NCBI
GUCCUGGAGGCUUCAUUGAGCUGCUGAGCAGAAGCUGAAACACAGAAUU… 2583 nt 0.5978
Summary

Enables sodium:phosphate symporter activity. Involved in several processes, including phosphate ion homeostasis; response to cadmium ion; and response to lead ion. Located in several cellular components, including apical plasma membrane; mitotic spindle; and nuclear speck. Implicated in several diseases, including Fanconi syndrome (multiple); chronic kidney disease; hereditary hypophosphatemic rickets with hypercalciuria; hypophosphatemic nephrolithiasis/osteoporosis 1; and nephrolithiasis. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the SLC34A1 is expressed in kidney tissue with an average read count of 16,085 and was part of a targeted 46-mRNA biomarker panel for definitive organ identification using massively parallel sequencing, which showed high specificity and successfully identified tissue sources in a single-blind study [Hanson & Ballantyne DOI:10.3390/genes8110319]. The SLC34A1 is also cited as a marker for kidney identification in forensic transcriptomics reviews summarizing tissue identification applications [Lei et al. DOI:10.1093/gpbjnl/qzag007].