Basic Information

Symbol
SLC35E3
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 35 Member E3 BLOV1 Bladder Cancer-Overexpressed Gene 1 Protein Solute Carrier Family 35, Member E3 Solute Carrier Family 35, Member E2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_018656.5
Sequence length
17722.0 nt
GC content
0.4414

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-6860.74 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: 100000.00 kcal/mol
Frequency: inf
Diversity: 0.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCCUAGCUGGCUUACAGGGCGGCGGCGGGGUGUGUGUCCUCUGUUAAG… 17611 nt 0.4421
GUCCUAGCUGGCUUACAGGGCGGCGGCGGGGUGUGUGUCCUCUGUUAAG… 1309 nt 0.5042
GUCCUAGCUGGCUUACAGGGCGGCGGCGGGGUGUGUGUCCUCUGUUAAG… 17722 nt 0.4414
Summary

Predicted to enable antiporter activity and nucleotide-sugar transmembrane transporter activity. Predicted to be involved in transmembrane transport. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in Golgi apparatus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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