Basic Information

Symbol
BACE2
RNA class
mRNA
Alias
Beta-Secretase 2 ALP56 ASP1 DRAP Aspartyl Protease 1 Theta-Secretase CEAP1 AEPLC Membrane-Associated Aspartic Protease 1 Beta-Site APP-Cleaving Enzyme 2 56 KDa Aspartic-Like Protease Down Region Aspartic Protease Memapsin-1 ASP21 Beta-Site Amyloid Beta A4 Precursor Protein-Cleaving Enzyme 2 Beta-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme 2 Down Syndrome Region Aspartic Protease Transmembrane Aspartic Proteinase Asp1 Beta-Site APP Cleaving Enzyme 2 Aspartic-Like Protease 56 KDa SLCO3A1/BACE2 Fusion EC 3.4.23.45 Memapsin 1 EC 3.4.23 CDA13 Asp 1 BAE2
Location (GRCh38)
21:41167801-41282530
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012105.5
Sequence length
8567.0 nt
GC content
0.4647

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2787.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2949.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2418.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012105.5 NCBI
AUCCCUGCCCGCAGCCCCGCGCGCCGGCCGAGUCGCUGAGCCGCGGCUG… 8567 nt 0.4647
NM_138991.3 NCBI
AUCCCUGCCCGCAGCCCCGCGCGCCGGCCGAGUCGCUGAGCCGCGGCUG… 8417 nt 0.4641
NM_138992.3 NCBI
AUCCCUGCCCGCAGCCCCGCGCGCCGGCCGAGUCGCUGAGCCGCGGCUG… 8398 nt 0.4626
Summary

This gene encodes an integral membrane glycoprotein that functions as an aspartic protease. The encoded protein cleaves amyloid precursor protein into amyloid beta peptide, which is a critical step in the etiology of Alzheimer's disease and Down syndrome. The protein precursor is further processed into an active mature peptide. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.