Basic Information

Symbol
SLC39A2
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 39 Member 2 ZIP2 Solute Carrier Family 39 (Zinc Transporter), Member 2 Zrt- And Irt-Like Protein 2 ZRT/IRT-Like Protein 2 Zinc Transporter ZIP2 Zinc Transporter 2 ZIP-2 6A1 Zinc Uptake Transporter 2 ETI-1 Eti-1 HZIP2
Location (GRCh38)
14:20999255-21001871
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014579.4
Sequence length
1376.0 nt
GC content
0.5065

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-463.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -491.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256588.2 NCBI
AGAAGCAGAAGCAACACAGAAAGAAGAUACCAACAGCCUCCUGAAACUC… 1371 nt 0.5069
NM_014579.4 NCBI
AGAAGCAGAAGCAACACAGAAAGAAGAUACCAACAGCCUCCUGAAACUC… 1376 nt 0.5065
Summary

This gene encodes a member of the ZIP family of metal ion transporters. The encoded protein functions as a zinc transporter. Mutations in this gene may be associated with susceptibility to carotid artery disease. Multiple transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.