Basic Information

Symbol
SLC5A1
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 5 Member 1 NAGT Sodium/Glucose Cotransporter 1 D22S675 SGLT-1 SGLT1 Solute Carrier Family 5 (Sodium/Glucose Cotransporter), Member 1 High Affinity Sodium-Glucose Cotransporter Na(+)/Glucose Cotransporter 1 Na+/Glucose Cotransporter 1
Location (GRCh38)
22:32043050-32113029
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000343.4
Sequence length
4832.0 nt
GC content
0.4607

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1546.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1632.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 981.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000343.4 NCBI
GAAGGACGCAACGCUGCCACCAUGGACAGUAGCACCUGGAGCCCCAAGA… 4832 nt 0.4607
NM_001256314.2 NCBI
GAAUUUCAUGCCACAGCUGAGAGGCAGAAGUUACAGUGAGCCGAGAUCA… 4811 nt 0.4573
Summary

This gene encodes a member of the sodium-dependent glucose transporter (SGLT) family. The encoded integral membrane protein is the primary mediator of dietary glucose and galactose uptake from the intestinal lumen. Mutations in this gene have been associated with glucose-galactose malabsorption. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012]

Forensic Context

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