Basic Information

Symbol
BAG1
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 1 BAG Family Molecular Chaperone Regulator 1 BCL2 Associated Athanogene 1 BAG-1 HAP Glucocortoid Receptor-Associated Protein RAP46 Bcl-2 Associating Athanogene-1 Protein Receptor-Associated Protein, 46-KD Bcl-2-Associated Athanogene 1 BCL2 Associated Athanogene BCL2-Associated Athanogene Bcl-2-Binding Protein RAP46
Location (GRCh38)
9:33247820-33264720
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004323.6
Sequence length
3820.0 nt
GC content
0.4872

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1290.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1359.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1005.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001172415.2 NCBI
AGCUUCCAUCGCUGGGCGGUCAACAAGUGCGGGCCUGGCUCAGCGCGGG… 3820 nt 0.4872
NM_001349286.2 NCBI
AGCUUCCAUCGCUGGGCGGUCAACAAGUGCGGGCCUGGCUCAGCGCGGG… 3820 nt 0.4872
NM_001349299.2 NCBI
AGCUUCCAUCGCUGGGCGGUCAACAAGUGCGGGCCUGGCUCAGCGCGGG… 3820 nt 0.4872
NM_004323.6 NCBI
AGCUUCCAUCGCUGGGCGGUCAACAAGUGCGGGCCUGGCUCAGCGCGGG… 3820 nt 0.4872
Summary

The oncogene BCL2 is a membrane protein that blocks a step in a pathway leading to apoptosis or programmed cell death. The protein encoded by this gene binds to BCL2 and is referred to as BCL2-associated athanogene. It enhances the anti-apoptotic effects of BCL2 and represents a link between growth factor receptors and anti-apoptotic mechanisms. Multiple protein isoforms are encoded by this mRNA through the use of a non-AUG (CUG) initiation codon, and three alternative downstream AUG initiation codons. A related pseudogene has been defined on chromosome X. [provided by RefSeq, Feb 2010]

Forensic Context

A study in human postmortem prostate tissues demonstrated that the BAG1 is an anti-apoptotic gene whose expression is significantly upregulated in a time-dependent manner for time of death estimation [Tolbert et al. DOI:10.1016/j.gene.2018.06.090]. The research, using PCR Array analysis on samples with postmortem intervals up to 120 hours, validated that the BAG1 showed a fold regulation of 16.0867 at 96 hours and 21.3257 at 120 hours, indicating its measurable and significant elevation as the postmortem interval increases.