Basic Information

Symbol
SLC8A3
RNA class
mRNA
Alias
Solute Carrier Family 8 Member A3 NCX3 Solute Carrier Family 8 (Sodium/Calcium Exchanger), Member 3 Na(+)/Ca(2+)-Exchange Protein 3 Sodium/Calcium Exchanger 3 Solute Carrier Family 8 Member 3 Sodium/Calcium Exchanger SLC8A3
Location (GRCh38)
14:70044215-70189480
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182932.3
Sequence length
5133.0 nt
GC content
0.5151

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1816.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1913.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1282.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130417.3 NCBI
AAAUAUAGUCUGAGUAUCAACUCUUCCAGCAUGGAGCCGAAAACCUAGG… 2967 nt 0.4729
NM_033262.5 NCBI
CUCUCCGCGCGUCCCCUCUGCGCGCGGCGAGGCCGAGACGUCUCCCGCG… 5145 nt 0.5149
NM_058240.4 NCBI
CUCUCCGCGCGUCCCCUCUGCGCGCGGCGAGGCCGAGACGUCUCCCGCG… 5142 nt 0.5154
NM_182932.3 NCBI
CUCUCCGCGCGUCCCCUCUGCGCGCGGCGAGGCCGAGACGUCUCCCGCG… 5133 nt 0.5151
NM_182936.3 NCBI
AAAUAUAGUCUGAGUAUCAACUCUUCCAGCAUGGAGCCGAAAACCUAGG… 2863 nt 0.4754
NM_183002.3 NCBI
CUCUCCGCGCGUCCCCUCUGCGCGCGGCGAGGCCGAGACGUCUCCCGCG… 5151 nt 0.5152
Summary

This gene encodes a member of the sodium/calcium exchanger integral membrane protein family. Na+/Ca2+ exchange proteins are involved in maintaining Ca2+ homeostasis in a wide variety of cell types. The protein is regulated by intracellular calcium ions and is found in both the plasma membrane and intracellular organellar membranes, where exchange of Na+ for Ca2+ occurs in an electrogenic manner. Alternative splicing has been observed for this gene and multiple variants have been described. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

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