Basic Information
Symbol
BAG3
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 3
BAG Family Molecular Chaperone Regulator 3
BCL2 Associated Athanogene 3
Bcl-2-Binding Protein Bis
Docking Protein CAIR-1
BAG-3
BIS
Bcl-2-Binding Protein BIS Transcript 2
Bcl-2-Associated Athanogene 3
BCL2-Binding Athanogene 3
CAIR-1
CMD1HH
CMT2JJ
HMND15
MFM6
Location (GRCh38)
10:119650879-119677913
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_004281.4
Sequence length
2561.0 nt
GC content
0.5685
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-902.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-947.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
593.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCAUCCAACCCCGGGCCGCGGCCAACUUCUCUGGACUGGACCAGAAGUU… | 2561 nt | 0.5685 |
Summary
BAG proteins compete with Hip for binding to the Hsc70/Hsp70 ATPase domain and promote substrate release. All the BAG proteins have an approximately 45-amino acid BAG domain near the C terminus but differ markedly in their N-terminal regions. The protein encoded by this gene contains a WW domain in the N-terminal region and a BAG domain in the C-terminal region. The BAG domains of BAG1, BAG2, and BAG3 interact specifically with the Hsc70 ATPase domain in vitro and in mammalian cells. All 3 proteins bind with high affinity to the ATPase domain of Hsc70 and inhibit its chaperone activity in a Hip-repressible manner. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the BAG3 gene, an anti-apoptotic protein and indicator of cellular stress, was downregulated in subcutaneous adipose tissue during both short-term and long-term weight loss interventions [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245]. In a separate forensic investigation of human cadaver liver tissues, the BAG3 was found to be downregulated more than sixfold in decaying tissues compared to a control, contributing to the apoptotic thanatotranscriptome profile observed with increasing postmortem interval [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6].