Basic Information

Symbol
SLFN12L
RNA class
mRNA
Alias
Schlafen Family Member 12 Like Schlafen Family Member 12-Like SLFN5
Location (GRCh38)
17:35464249-35537683
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001363830.2
Sequence length
13219.0 nt
GC content
0.4139

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4146.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4388.48 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2969.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001195790.3 NCBI
ACCACUGUCCUCAGCCAAACUGCAGGGACUCCUAAGUAGAUCAGAGCUC… 13466 nt 0.4175
NM_001363830.2 NCBI
ACCACUGUCCUCAGCCAAACUGCAGGGACUCCUAAGUAGAUCAGAGCUC… 13219 nt 0.4139
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the SLFN12L as an important gene with a positive coefficient in a lasso regression model derived from a DESeq2-selected list for age prediction using U.S. whole blood RNA-Seq data [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976]. This research, which analyzed mRNA from dried blood stains and public datasets, demonstrated that lasso-selected gene lists, which included the SLFN12L, provided superior age prediction performance with a mean absolute error of 4.35 years in the U.S. dataset.