Basic Information

Symbol
BAG6
RNA class
mRNA
Alias
BAG Cochaperone 6 G3 D6S52E Scythe BAT3 BAG Family Molecular Chaperone Regulator 6 Large Proline-Rich Protein BAG6 HLA-B-Associated Transcript 3 BCL2 Associated Athanogene 6 Protein Scythe Protein G3 BAG-6 Large Proline-Rich Protein BAT3 HLA-B Associated Transcript 3 BCL2-Associated Athanogene 6
Location (GRCh38)
6:31638544-31652747
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001387994.1
Sequence length
3843.0 nt
GC content
0.6008

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1559.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1623.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1242.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001388004.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3587 nt 0.5960
NM_001388005.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3599 nt 0.5941
NM_001388006.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3602 nt 0.5941
NM_001388007.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3638 nt 0.5951
NM_001388008.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3665 nt 0.5956
NM_001388009.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3668 nt 0.5957
NM_001388010.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3746 nt 0.5974
NM_001388011.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3749 nt 0.5975
NM_001388012.1 NCBI
GAAGUCGGGGGCGGAGCCGCGGGGUGGUGGGUGUGUGUGUGUGUGUGUG… 3776 nt 0.5980
NM_001388013.1 NCBI
AAACCACUUUCUCCGCAGAGUGUGGGGCGACCACCGCUUUCGCGUUGUC… 3419 nt 0.5899
Showing 41 to 50 of 59 entries
Summary

This gene was first characterized as part of a cluster of genes located within the human major histocompatibility complex class III region. This gene encodes a nuclear protein that is cleaved by caspase 3 and is implicated in the control of apoptosis. In addition, the protein forms a complex with E1A binding protein p300 and is required for the acetylation of p53 in response to DNA damage. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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