Basic Information

Symbol
SMAP2
RNA class
mRNA
Alias
Small ArfGAP2 SMAP1L Stromal Membrane-Associated GTPase-Activating Protein 2 Stromal Membrane-Associated Protein 1-Like Stromal Membrane-Associated Protein 2
Location (GRCh38)
1:40344850-40423326
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022733.3
Sequence length
2905.0 nt
GC content
0.5253

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1046.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1099.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 777.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001198978.2 NCBI
GAGAGAGAGAAUGACGAGGAGGAGGAGGAGGGAAGUGAGAUGGCGGAAA… 2484 nt 0.4859
NM_001198979.2 NCBI
ACAAAUGAGUGAGUGCAGCAGGAGAGGCAGCAGAGCGCCGUGGGAGUUG… 2568 nt 0.4860
NM_001198980.1 NCBI
ACACAAUUUUUCCAAGAUCCCACUGGUGUUUCUGUGUAUUCUUCCUUUU… 2519 nt 0.4811
NM_022733.3 NCBI
GGAGGUGGUAGCGGAGCUGACGGCAGCUGCCAGGGAAACCGAGGCGCGG… 2905 nt 0.5253
Summary

Predicted to enable GTPase activator activity. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human whole blood demonstrated that the SMAP2 mRNA exhibits significant diurnal differential expression for time-of-day prediction, with peak expression at 08.00h and a valley at 02.00h [Gosch et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102915]. The qPCR validation in dried and aged bloodstains showed that the SMAP2 maintained this significant differential expression in stains stored for 12 hours and one week at room temperature, confirming its forensic suitability for time-of-day estimation in aged evidentiary samples.