Basic Information

Symbol
SMARCC1
RNA class
mRNA
Alias
SWI/SNF Related BAF Chromatin Remodeling Complex Subunit C1 BAF155 CRACC1 SRG3 Rsc8 SWI/SNF Related, Matrix Associated, Actin Dependent Regulator Of Chromatin Subfamily C Member 1 SWI/SNF-Related Matrix-Associated Actin-Dependent Regulator Of Chromatin Subfamily C Member 1 SWI/SNF Complex Subunit SMARCC1 SWI/SNF Complex 155 KDa Subunit BRG1-Associated Factor 155 SWI/SNF Related, Matrix Associated, Actin Dependent Regulator Of Chromatin, Subfamily C, Member 1 Mammalian Chromatin Remodeling Complex BRG1-Associated Factor 155 Chromatin Remodeling Complex BAF155 Subunit HYC5 SWI3
Location (GRCh38)
3:47585269-47782106
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003074.4
Sequence length
6354.0 nt
GC content
0.4647

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1999.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2116.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1946.0
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003074.4 NCBI
AGUGGCGGCUACGCGCGCGGGGGUGCGCGCGGGAACGACCGGGAAACAC… 6354 nt 0.4647
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the SWI/SNF family of proteins, whose members display helicase and ATPase activities and which are thought to regulate transcription of certain genes by altering the chromatin structure around those genes. The encoded protein is part of the large ATP-dependent chromatin remodeling complex SNF/SWI and contains a predicted leucine zipper motif typical of many transcription factors. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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