Basic Information

Symbol
BAK1
RNA class
mRNA
Alias
BCL2 Antagonist/Killer 1 BCL2L7 BAK CDN1 Bcl-2 Homologous Antagonist/Killer Apoptosis Regulator BAK Bcl-2-Like Protein 7 Bcl2-L-7 Pro-Apoptotic Protein BAK BCL2-Antagonist/Killer 1 BCL2-Like 7 Protein BAK-LIKE
Location (GRCh38)
6:33572547-33580305
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001188.4
Sequence length
2170.0 nt
GC content
0.5862

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-939.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -978.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 541.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001188.4 NCBI
ACAGAGCAACUUCCUCUAGAGGGAGCUGAUUGGAGCCGGGUGCCGCUGG… 2170 nt 0.5862
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the BCL2 protein family. BCL2 family members form oligomers or heterodimers and act as anti- or pro-apoptotic regulators that are involved in a wide variety of cellular activities. This protein localizes to mitochondria, and functions to induce apoptosis. It interacts with and accelerates the opening of the mitochondrial voltage-dependent anion channel, which leads to a loss in membrane potential and the release of cytochrome c. This protein also interacts with the tumor suppressor P53 after exposure to cell stress. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human cadaver liver tissues demonstrated that the BAK1 was down-regulated (-1356.767 fold) in decaying samples compared to a control [Javan et al. DOI:10.1007/S12024-015-9704-6]. In human prostate tissues, the BAK1 was significantly upregulated at longer postmortem intervals (96 and 120 hours) compared to a 24-hour control, indicating its utility for time-of-death estimation [Tolbert et al. DOI:10.1016/j.gene.2018.06.090]. A study in mice and human hematopoietic cells demonstrated that the proapoptotic factor Bak was upregulated in mouse bone marrow and spleen cells following γ-irradiation [Li et al. DOI:10.1007/s10495-016-1238-1].