Basic Information

Symbol
SMIM23
RNA class
mRNA
Alias
Small Integral Membrane Protein 23 C5orf50 LOC644994 Chromosome 5 Open Reading Frame 50 CTB-78H18.1
Location (GRCh38)
5:171782432-171796126
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001289970.2
Sequence length
622.0 nt
GC content
0.5418

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-221.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -231.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((........(((((((.(.(((((((((((((.(((((((...........((((((((.((((((.....((...(.(...((..((((.((((.((((..((.(......).))...)))).))))))))..)).).)...))....)))))).)).))))))(((((.(((((.......))))).))))).(((((((((((((((..(((..((...............))..)))....))))....))))..)))))))((((((((.............))))))))..................)).)))))..)))))))....((..(((((((.(((((((..........)).))))).)))))))..))((((((.(((((...((........))...))))).)))))))))))).).)))))))))))))).)))))(((((.((((...........)))))))))..((((((...(((((..((((((((....))).(((((((((......)))))))))...((((((...)))))).))))).....)))))))))))...........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((((((((({,,,.,,..((((({(,{.(((((((((((((.(((((((,,.,{{.....((((((((.((((((.....((...{.,,..((..((({{((((.((((..((.(,,....}}))...)))).))))))))..)).}.,...))...,)))))).)).))))))(((((.(((((.......))))).))))).(((((((((((((((..(((,,{{...............}}..,)}.},.))))...,))))..)))))))((((((((.............)))))))).........,......}.)).)))))..)))))))....((..(((((((.(((((((.,,....,,.)))))))).)))))))..))((((({.{{{((.,,({.,...,..)),,,))))).}}|}}}}}}))).}.)))))))))))))).))}||(((((.(({{.........,,)))})))))}}(({{{{,,,|||||..||{{||||....)}).||||||||{,,,,,,|}}}}))))..,|(((((...)))))}.))))}....,}}}))})))))..............,.,,,,.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289970.2 NCBI
AGGGUGCCCUUCUGUCUGUUGAGUGUGGUCCACCCAGGCAGCCAGAUCU… 622 nt 0.5418
Summary

Predicted to be located in plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.