Basic Information

Symbol
SMIM3
RNA class
mRNA
Alias
Small Integral Membrane Protein 3 NID67 C5orf62 NGF-Induced Differentiation Clone 67 Protein Small Membrane Protein NID67 MSTP150 Chromosome 5 Open Reading Frame 62 Uncharacterized Protein C5orf62 MST150
Location (GRCh38)
5:150778741-150796736
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032947.5
Sequence length
1521.0 nt
GC content
0.5135

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-539.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -565.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 396.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032947.5 NCBI
GCAUUCCAGAGCCAGCAGCGCGUCCUGGCCGCUCCUGCGCUCUCCCGCC… 1521 nt 0.5135
Summary

Enables identical protein binding activity. Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in BXD F1 mice demonstrated that perinatal morphine exposure caused sex-specific transcriptional changes in prefrontal cortex microglia, with SMIM3 being downregulated in both female and male offspring [Smith et al. DOI:10.1016/J.Bbi.2025.03.016].