Basic Information

Symbol
SMUG1
RNA class
mRNA
Alias
Single-Strand-Selective Monofunctional Uracil-DNA Glycosylase 1 HMUDG UNG3 FDG Single-Strand Selective Monofunctional Uracil DNA Glycosylase EC 3.2.2.- EC 3.2.2
Location (GRCh38)
12:54121277-54189008
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001243787.2
Sequence length
2681.0 nt
GC content
0.5099

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-978.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1026.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 545.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014311.3 NCBI
AAAGGAACCGGAAACGGGAUGGGGAGCUGGACCAGCAGAUUAUGAGCUU… 2684 nt 0.5101
Showing 31 to 31 of 31 entries
Summary

This gene encodes a protein that participates in base excision repair by removing uracil from single- and double-stranded DNA. Many alternatively spliced transcript variants exist for this gene; the full-length nature is known for some but not all of the variants. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A topographic transcriptomic analysis in mice identified SMUG1 as one of five seed transcripts with highly specific enhanced expression in the nucleus accumbens shell (NAcSh) [Crofton et al. DOI:10.1016/J.Neuropharm.2020.108398].