Basic Information
Symbol
SOCS3
RNA class
mRNA
Alias
Suppressor Of Cytokine Signaling 3
SOCS-3
SSI-3
CIS3
Cish3
Cytokine-Inducible SH2 Protein 3
STAT-Induced STAT Inhibitor 3
SSI3
ATOD4
CIS-3
Location (GRCh38)
17:78356778-78360930
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_003955.5
Sequence length
2734.0 nt
GC content
0.5999
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1148.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1198.41 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
746.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AUUCCCGGCAGGGAGGUGACGAGCCCCCCGGGAUGCGGUAGCGGCCGCU… | 2429 nt | 0.5784 | |
| GCCAUCGUUCCACCUCGAGCUCUCCAGCCCGGCCGAGAGCACCUGGCCC… | 2476 nt | 0.5808 | |
| GGCUCCGACUUGGACUCCCUGCUCCGCUGCUGCCGCUUCGGCCCCGCAC… | 2734 nt | 0.5999 |
Summary
This gene encodes a member of the STAT-induced STAT inhibitor (SSI), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS), family. SSI family members are cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene is induced by various cytokines, including IL6, IL10, and interferon (IFN)-gamma. The protein encoded by this gene can bind to JAK2 kinase, and inhibit the activity of JAK2 kinase. Studies of the mouse counterpart of this gene suggested the roles of this gene in the negative regulation of fetal liver hematopoiesis, and placental development. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in rats demonstrated that the SOCS3 (Suppressor of cytokine signaling 3) expression in iliopsoas muscle was significantly increased only by severe hypothermia, where it was regulated by rno-miR-203a-3p and contributed to suppressing apoptosis via the caspase-3 pathway, indicating its role in a biological defense response under extreme cold [Umehara et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2022.102150]. In a separate investigation using human and rat models of UVB-induced inflammatory pain, the SOCS3 was found to be up-regulated in skin, with a fold change of 13.7 in humans and 15.6 in rats, correlating with the inflammatory hyperalgesic response [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].