Basic Information

Symbol
SOD2
RNA class
mRNA
Alias
Superoxide Dismutase 2 LncRNA-GC1 GClnc1 MnSOD IPOB GC1 Superoxide Dismutase [Mn], Mitochondrial Superoxide Dismutase 2, Mitochondrial EC 1.15.1.1 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Manganese-Containing Superoxide Dismutase Gastric Cancer–Associated LncRNA 1 Gastric Cancer-Associated LncRNA 1 Manganese Superoxide Dismutase Mangano-Superoxide Dismutase Mn Superoxide Dismutase Indophenoloxidase B Mn-SOD IPO-B MVCD6
Location (GRCh38)
6:159669069-159762529
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000636.4
Sequence length
14167.0 nt
GC content
0.4153

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4434.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4702.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3399.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((((((..(((((.(((((((((((((....(((.((((((((.((..........)).)).)))))))))((((((.((.(((..(((((.....)))))..)))....(((((.....(((((....((....))..))))))))))))))))))...((((((((.((.((((((((((((.((((...(((.....))).(((((......)).)))(((((.((((.((((((((((((((.......((((((.((((((.(((((((((....)))....((((((((((((((((((.((((((((((......))))))((((((((((((((.((((((..(((.(((....((((((((((((((((((.((.(((.(((.....)))....(((.((..(((((((((.((((((......))))))((((((((.........(((..((((...))))...)))(((((((.(((.(((((((((.((((..((...(((((((((((((((.(((((......((((((((((((((.(((((....(((((...((.(((((((...(((((....((((((((((((.((((((.((.((((((.(((((((...(((((((((....(.((((...((((((((((((.....))))))...)))))).)))).)...))).)))))).(((.(.(((.((((.....)))).))).))))((((((..((((.......))))..)))))).((((((((((((........)))))))))).)))))))))))))))...((((((((....))))))))((((((((((..((((..(((((...((((((..(((....)))......)))))))))))..)))).)))))))))).....((((((((....(((((((...(((((..(((.....))))))))......)))))))...).)))))))...))))))))...........(((.......)))(((((...(((....)))....)))))..((((((.......))))))..............)))))).........................(((((....))))).(((((((........................)))))))...........((((((((......)).)))))).))))))........)))))...)))))))((((((((((.......)))))))))).(((((.......)))))..((((.((.((((((...((((((((((((((((((((.(((((((((((((((..(((((((((((.((((((((((((.(((((.(((((((((((((((..((.((.((((..((.(((((.(((((...((((....)))).)))))))))).))...(((.((..(((............))).))))).....((((((((((((..(((((((.((............((((((((((((((((....((((((...(((.((((((((((((((((((((((......(((..(((((((((((...((((((..(((.(..((((((.(((.((((((.(((...((((((((.((.(..........).)).))))))))(((.((((((.(((((...)))))..(((..((((((((((.(((((((((((......(((.((((((((((..(((((.......)))))((((.((((.(((((...((((.(((.....(((.(((((..(((((.(((.(((.((((...((....)).(((((((..((((((.(((.((((((.((((((.....(((..(((.(((.......))))))))).)))))))))))).))))))))).....)))))))..(((....))).((((((((..(((((((((((..(((((((((((.((((((((......)))))))).))((((((..(((((..((((((.(.(((....)))).))))))......(((((((((((((..........)))))))))))))((((...((((.(((((....((((((....((((((...(((.....((((((....((((((((......(((..((........(((((.((((((((..(((((((.((...((((.((((((((((((((...(((....))).((((((.((((...((((((((........(((........)))((((((((...))))))))((((.((.((((((((((((((.(.....).)).)))))))..)))))...)).))))..........(((((((.((((....))))...).))))))..(((((((.((((.....((..(((...(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(.((((((.((((((((....(((((((.((.(((((.((..((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(.((((((((..(((((.(((......))))))))..((((((..(((((.((((((..(((((.((((((((..(((....(((((((((((((((......((((((((((...((((....))))....)))))....)))))((((((.(((((((....(((......)))....))))))).)))))))))))))))))))))...)))..)))))))).)))))..((((.((((((((((((((........))))))))))).)))...))))..)))))).)))))...)))))).............(((.((((.(((((....))))))))).)))(((((.......)))))(((((...(((((((((...((((((....))))))((((((((((.((((..((((..(.(((..((((((((.(((.((((((.(((((.((((((.....))))))....)))))))))))..)))........((((((((.............))))))))...........)))))))).))).)..))))...)))).)))).))))))..)))))))))...)))))((((((((((.....))))).))))).(((((((.(((((((((((.((((.........)))).)))))..))))))...)))))))...((((((((((.(((........))).))))..)))))).....)))))))).).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))..)).))))).)).))))))))))))))).)))))).).))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))..)))..))(((((((((......)))))))))(((((((....)))))))(((((.....((((((...)))))).....)))))(((((........))))))))))))))))..((((((((.((((..............)))))))))))).(((.((((((.....((((..((((((.....)))))).....)))).....)))))).)))....(((((((......((..(((.((((........)))).)))..)).......)))))))...((((((((.(((((((...)))))))))))))))....)))))))).))))))))))......(((......))).)))))))))))))).))))....))........................(((((((((.(.........).))))))))).((((....))))......(((((....((((((....(((((((((((...(((((((..((((....((((.(((..((((((......))))))......)).).)))).....))))...)))))))(((......)))..((((.(((...(((((..(((.....)))..)))))...))).))))......((((((((((((((((..((((.......(((..(((........)))..)))))))....))).)))))))))))))....((((((....(((.((.......)).))).....)))))).))))))))))).....(((((((......))))))).))))))....)))))...)))))))..)))))))).))))).))..))).....))))))))....)))))))))..))))))......))))))...)))))..)))).))))...................(((..(((((((((...))).))))))..))).....(((....)))..((.((((((((.....(((......)))..)))))))).))...(((((((((((..(((((((((....((((((.(((.((((......)))).))).))).)))..))))))).((.(((..((((((((.((((...........((((((.((((((((..(((((.(((((.....))).))..)))))...................((((((((((((.(((((((((((......))))))...(((((((((.(((...(((..(((((((((......((((((((.(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((((..((.((.((((((.(((...(.(((((((.(((((.(((.((...((((((((((((.....(((((....((((((.((((((((((((((((....)).)))))))(((((((.(((((...((((.((((((((..........))))...)))).((((((...((((((((.....)).))))))......)))).))(((((((((.((((((.((..(...(((((....)))))....)..))))))))((((....(((((...(((...((((((((((..((((((((((...)))))))))).))))))).....))).))).((((((..((((((((((((....))))))))...)))))))))).........))))).)))).))))).)))).......((((((((((((((((...........)))))))))))))))))))).)))))..))))))).....(((((.(((((((((((((((.((................)))))).)))((((((.((((.((.......((.((((....)))).))........))))))..))))))..)))))))))))))...(((((.((((((((.....((......................)).....)))))))))))))...))))))).))))))....))))).....))))))))))))..)).))).))))).))))))).).))).))))))..)).)).)))))))))....))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).))))))))....(((((...........)))))............(((((((......))).)))))))))))))..))).)))))))))))).)))))))))).)))))))(((((((((...........))))))))).....))))))(((((..((((((((((........))))))..))))..)))))..)).)))))).))))...))))))))))).))((..((((((((...((......)).))))))))..))))...)).)))))))))....))))).))))))((.(((.......))).))...(((((((((.............(((((..((.(((.(((.(..(((((((((((....))))))....))))).).))).)))))..)))))....))))))))).....))))))))).))))))..((((((((.((((((((...((((...(((((..((.((.......((((((...))))))......)).)).))))).)))).))).))))))).))))))..(((((((..((((..(((((((((..(((.....)))))))))))).)))))))))))((....))...)))))..))).)))))....)))).))).)))..(((((...))))))))))..))))).)))))).))))...)))))))))..))))(((((......))))).................((((..((((.....))))..))))(((((((........(((.((...)).)))........))))))))))))))..))).)))..)))))).))))).(((.(((...((((((((((....))))))))))...))).)))(((((....)))))...)))))))))).)))((((((((((((((....(((....)))....)))))))))))))).....(((((...)))))..)))))).))).....(((((((.......)))))))....))).)))))))))))))))))))...)))))))))))))))))..))).((..((((((((((.(((((((((((..................)))))))))))..(((((............((.(((((((.(.(((.((((((((.((((............(((((((.......)))))))))))..)))))))).......))).).))))))).))............))))).........((((.....)))).)))))))..)))..))..........(((((((...((...(((((((...........))).))))...))...)))))))..)))))))))))..))).)))))))).))).....((((((((((((............)))))))....))))).(((((((.(..(((((......(((..((((.(.(((.......))).).))))...)))....)))))..).)))))))..)))))).....)))))))..)))))..))))...((((((...((..(((.((....)).)))..))...)))))))).))))))))))).)))).)))))))))).))..)))))))))))))))(((((((((...)))))))))((((.(((((....))))))))))))))...........(((((((((((((((((((((((...(((..((((.............)))).)))....)))))..))))))..)))))).)))))))))))))))))).)))....)))))))).))).)))).........))).)))))))))))))))))))..(((((((.......((.((((((............((((.......))))..((((..(((((..(((((.(((((.((..((((..((((((((((.....))....)))))))).........))))......))))))).)))))))))).))))(((((...(((((((.((........)).))))))))))))..))))))))(((((((((..(((((...((((.((.(((...(((((((..............(((((....)))))....(((.(((((((..........))))))).))).((.(((((((..((((...........(((((...)))))...))))..))))))).))......(((((....))))))))))....))..))))))))).)))))...)).))))))))))).))))))).)))))))).)).)))).....))...)))))..)))))))).))))(((((((...(((((.....)))))..)))).))).(((((.........)))))(((((((((((((((((..(((((((.....(((.(((((((((((....(((......)))........((((..((....)).))))(((((((((((((.....)))))..))))))))..(((............)))..))))))))))))))....(((((.....))))))))))))..))))))(((((((((..(((.....((((...)))).....)))..))))))))))))))))))))...(((((((((((.....((((((((.(((((((.......))))))).)))))))).......(((((((((((.((..((((........)))).)))))))))))))...(((((((..((((((........))))))..)))))))))))))))))))))))))...)))))..)))))))))))).)))........))..)))).))))))..))).))).))......))))).((((.....))))((.((((((((.((((...)))).))))..)))).)).))))))))...)))))))))..)).))).......))).))..))))).))))))))).))))..)))..........)))))))))..)))))).........))))))))........(((.((((((((...((......))...)))))))).)))((((....)))).((((.((((.((((((((((((...(((......(((((.((((...(((......)))...).))).)))))...)))..)))))))))))).)))).))))...........)))).)))).......((((....))))..(((((((((((..((((((((........))))))))...)))))))))))..((((....))))............(((((((((....(((((.((((.((.(((((((((.(((......))).)))).(((((.(((....(((((......)))))....))).)))))....))))))).)))).))))))))))))))....))))))))...)))))).))))))))))))))))))....((((...........)))).....(((((((.....(((((......(((((((((((((.......)))))).((((.((((((((.(((.((((((((...............(((((...)))))......((((((((((............))))))))))...((((.....((((....(((((......)))))...)))).......)))).....(((((...((.((.....((........)).......)).))...)))))(((.((((...........))))))).)))))))).))).)))))))).)))).........)))))))......)))))...)))))))...((((...............))))(((.(((((((...(((((.(((...((((((((((.........))))))))))...)))...................(((((.(.((((((.(((((.((((..........)))))))))........))))))))))))....((((.(..(((....((((((..(((....)))))))))....)))..)))))..(((......))).....))))).))))))).))))))))))))).......)))))))).))))).)))))))))..((........))))))))).......)).)))))))).(((((((.((......))..))).))))....))))))))))).((((((...((((((...((....))...)))))).)))))).(((((.((.((((((((((((...((((((....(((((((((((.((((((((((((((....(((((((.((((((.((((.((((((.((.(((..(((((..(((((...(((.(((((.(..((((((((((((.((((.(((((((((...((((((.(.(((((((((((((.((((((((..(((((((.(((((((........(((.(((((..((((((((..(((.((...(((((((((((((((((.((((((...((((((.....)))......((.((((......)))).)).((((((((((..((((.....((((((((..(((...((((....(((.((((((((..((......((....(((.((((((((..((((((...)))))).((((((((..(.((((((((((((((..(((((((((((((((((.(((((((((....))......(((.((((....)))).)))..((..((((((..(((((((.(((((((..(((((..(((((..(((((.((((((((.(((.(.......).))).))))))))...((((((....)))))).......)))))...))))))))))..)))))))..........(((.....)))............(((......))).((((((((....((..((((((......(((((..((((((..(..((((...((((((((((((((((.((((((.....(((((((((..(((......)))(((((.........))))).......(((((((.....(((((((...((......(((((((..((((..((((...))))....)))).)))))))....))...)))))))....))))))))))))))))(((((((...)).)))))(((...(((.....)))...)))((.(((((((((((((......((((((((.....((((.........(((.((((.(.((((..(((..((((.(((........))).)))).)))..)))).).)))).))).......))))...)))))))).........))))))..))))))).))....((((...))))...((((((....(((...)))...))))))....)))))).)))))...(((((((.......)).)))))......(((.(((.(((.......)))..))).))).......................................................((((..((((....(((((.............((((((......((((...((((((((((((....).)))).)))).))).))))......))))))..((((((((((((..((((....(((.(((((.....))))))))......))))...........(((((...((((.((.....((((((.(((((((((.(((........))))))))))))..(((.((.((...((((((((..(((..(((((.(((.((((..(((((...........)))))...))))..)))...)))))))).)))))))).)))).)))....(((((....(((......)))..)))))...)))))).....)).))))...))))).(((...(((.(((((((....(((((((((((((.(((((((((((((.(((((.(((((((........))))))).)))))..((.((((.(((.....))).)))).)).))))))))))))))))))))))))))(((((..(((((((....))))).)).((((((...))))))..((((((...))))))..........((((((((.......)).))))))(((((((..(((.((((((.((......)))))))).)))))))))).)))))..((((.....((((((((((((.....(((((((((((((.(((((...(.((((........)))).)...)))))...))).))))))))))(((((((((((.((.((...(((((((....))))(((((.(((((...((((((...(.((((((((...((((.(((((((((.(((((((.(.((.((((....((((((((..((((...)))).)))))))))))))).).))))))).........((((....)))).....))))))))))))).(((.((.(((.((((((...((((((........)))))).)))...))).))))).)))......)))))))).)....)))))).)))))))))).......(((((((((((.((((.((((.....))))..))))))).))))))))((((.....))))...)))...)).)))))))..))))))((((((........))))))..)))))))))))).))))....(((((((((...))))))))).....((((((((.....))))))))....)))))))))).)))(((((............)))))))))).)))))))...)))))..))))..)))).....)))))))..))))..))))..)..))))))..)))))))))))....))...))))))))(((((........))))).))))))).........(((((((((.(((......))))))))))))....))))))..)).........))).)))).))))).)))))))))...((((((((.......................))))))))..((.(((((((.......))))))).)).....)))..)))))))))))))).)..)))))))).)))))))).))))).....)))))))))).)))..)))))))..))))....))))....))))..)))).))).))).............(((((..((((((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((..((((((.((.((((((((((((.((((.((((((((.((((.((((((((((((((((((((........((((((((.((...((......))....))))))))))((((..(((((((((.(((((((((((..((((((((..(((..((((.((((....)))))))).(((((((....)))))))(((((......)))))..((((((...)))))).....)))..)))).))))..)))...((((((.......)))))).....((((((...................))))))....)))))))))))))..((((((((.((((((((.(((........)))...))).)..)))))))))).)))))).))))........(((((....)))))......(((.((((((((.........((((.......(((...))).......))))......)))))))).)))...........((((...)))).......(((((((((...((.(((((((..((...((.(((....))).))))..))))))).)).))))))))).........)))))))))))))))))))).)))).)))))))))))).)))))))))))).)).))).)))..)))))))))).))))))))))))))))).))))))))))).))).))))))))))..))))))))...))))))....)))))))))))))))))...)).)))..))))))))))))).)))........))))))).)))))))..)))))))).))))))))))))).).))))))))))))))).)))).))))))))))))..).))))).)))...))))))))))))).)).)))).)))))).)))))).))))))))))))))))))))).)))..............)))))))).....))))))...)))))))))))).)).)))))..........(((((.....)))))......))..)))))..))........)))))))))).)))))........(((((..........))))).((((((.....))))))((((.(((((.....((.(((((((......))))).)))).....)))))..)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,(({((((({(({{{{.,{||||,,||{(((((((((.,{{(((,({,(((({.{{.,,.|,.|{,||.||.|||||,|||({(({{.||.|||,.{||||,.,,.)))))..}}},,..{((((...{{(,(((....,,.,.,)).})),,,))))))})))|||,,,((((((((.({.{((((({(((((.((({...(((.....))).(((((......)),,))(((((.((({,(((((({({((((((,,{..,(((((((((((((.(((((((((....)))..,.((((((((((((((,,{({((((((((({..,{,.}}|||}{(((((((((((((.((((((,,{,{.(((....((((((((((((((((((....{{(,({{{,...,})},..(((.(,..(((((((((.,(((({......})))}|((((((((..,,,,,..{{,,.{(((...|}}},|.|}}||||||{,(((.(((((((((.((((..((...(((((((((((((({.(((((.{{{{((((((((((((((((((......)))}...,{{{.(((((((...(((((.,,..{(((((,(((((((({{(,((.((((((.(((((((...(((((({({....(.((((...((((((((((((.....))))))...)))))).)))).)...}}},}))))).(((.(.(((.((((.....)))).))).))))((((((..((((.......))))..)))))),((((((((((((.{....}.)))))))))).)))))))))))))))...((((((((....))))))))((((({((((..{(((..(((((...((((((..({{........,,}..))))))}})))..}|||,||}}|||}}}.....(((((((,....(((((((...(((((..(((....,)),)))))......)))))))...}.)))))))...,}}}}}},...........{{{.......)))(((((.,.(((,...)))..,.)))))..{(((((.......})))}}...,,}}},.,}}})}},}}|.,................,.,,..{((((....))))}.(((((((........,,,,............))))))),,}}))).)))}}},.{({.{{{{,,|..,,).,)))),)))....,,.)))))...)))))))((((((((((.......)))))))))),,((({,...{{{.((((((((.{.((((....))))}.))))))))))),,,.||}}}..,,,..,,,}},..((((((((((.....))))))))))(((((((((((((((,.....{{{{{(({{,,,,.}|{.(((({,(((((...((((....)))).)))))))))).,,..,.|||.}},,(((((((({{{(((((((((((({...........,(((((((((((((((({,,{{{...,,{{{{{({{(,{(((,(((.(((((((((({((,.,,|||||||,{{,(((((((((,{(({.(((,,(((((((((((...((((((..(((.(..((((((.(((.((((((.(((.,,((((((((.((.(,..,....,,},)),))))))))||(.((((((.(((((...))))).,{{{..((((((((((.(((((((((((.{....(((.((((((((((..(((((.......)))))((((.((((.(((((...((((.{((.....(((.(((((..(((((.(((.(((.((((...((....}),(((((((..((((((.{(,.((((((.((((((.....(((..(((.(((.......))))))))).)))))))))))).}),)))))).....))))))}..(((....))).((((((((..(((((((((((..(((((((((((.((((((((......)))))))).}}....||,,||,....((((((.(.(((....)))).))))))...,..{{{|{((((((((..........)))))))))}}}}{,,,.,.((((.,{{{{....,,,,.,},.,{|{{{{,..,,,,.{{{(((((({(({(((((((({,....}},..{{{,,.....(((({.{{{{||||.{((((((({,{...((((.((((((((((((((,.,{....,{((,.(((({,,(((,,,.((((((((........{({........})}|(((((((...)))))))}((((.((.((((((((((((({,(.....}.)),)))))))..)))))...)).)))).,..,,,,..((((((,,((((....))))...).))))))..(((({(({((,,..}}}}}}}}(({{.(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(.((((((.((((((((....(((((((.((.(((((.((..((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.(.((((((((..(((((.(((......))))))))..((((((,.(((((.((((((,,{(((,.((((((((..(((....(((((((((((((((,.,,,{{,,,,,}}}}}}}||{{....}}},.,,,||{{{....)))}|((((((.(((((({....{{{......,}}.,..))))))}.)))))))))))))))))))))...}}}..)))))))).})))}}.((((,((((((((((((({.......,}))))))))))}},),,.}}}}..}))))).)))))...))))))..........,,,(((.((((.(((({....})))))))).)))|||{{.......))}}}(((((...(((((((({...((((({....))))))((((((((((.(((,..((((..(.(((..(((((((({((({((((((.(((((.((((({,....}}))}}.,..)))))))))))..,,,}}}}}},.((((((((..,{.....,,..))))))))...........}})))))).))).)..))))...)))}.)))))))))))..}))))))))...)))))((((((((((.....)))))}})))).(((((((.((((({(((({,({{{.......,.)))},))))).,}))))}...))))))),{,{(((({((((.(((........))).))))..)))))).,,,.)))))))).).)))).))))))))))))))))))))))))))))))))..)).))))).)).))))))))))))))).)))))).).))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))..},.,}))(((((((({......))))))))){((((((....))))))}(((((.....((((({...}))))).....)))))((({{.....,,,|},}}}|)))}}}))),.((((((((.((((.{.,,.....,.}.)))))))))))).(((.((((((.....((((.(((((((.....))))))})...)))).....)))))).)))....{((((((.,....((..(((.((((........)))).)))..)).....,.)))))))...((((((((.{((((((...))))))}))))))))....)))))))).}),,)))),),}.}}}}.,.....,).,.)))))))))))))).))))....,,.........,,.....,.,,{{{.(((((((((.|.........}.))))))))),|}}||{{,,,,|....,,{{{(({,..{,||||}...|{{{{||||||,,.,,,||||,,{.||,,.,}|||}}}||}{(((((......)))))},..,|{{({({,,|,.....}))))}},))}},,{((......))}..((((.(((...(((((..(({.....}))..)))))...})}.)))}......((((((((((((((((..,,,,,{{....(((..(((.......,)))..))),,}}.,,,))).)))))))))))))....((((((...,(({.({.......}}.))).....)))))).)))))))))))}}..,||||||{,},..,)}}}}}}.|}}},}.,,,}}}}},..))))))}|,}}}||||},}}}}}.,,.{{((((((,|..|||||,{(((({|{{{.{{{..(((({...{{{{|....}})).,,}))))..))))}.}}.}))))}........|||,}||{{{{{((,,,||..}}))})},)),.....{{{....|||..((.((((((((.....(((......)))..)))))))).)).,,(((((((((({..(((((((((....((((((.(((.((((......)))).))).))).)))..))))))).{(.(({..((((((((.,(((...........((((((.({(({(((,,{{{{..((((.....))))..{{{{{{.....{{{{{{{{{....{{{((((((((.,,,.,,...,{(({({{(((({......}))))||{((({((,........,,|||||||...,,.((((((((.(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((((((..{{.{{.((((((.(((...(.(((((((.(((((.(((.((...((((((((((((.....(((((....((((({.(((((((.,,,{{,,,....||||||||}|(({{{,|,|||||,,||{((.,(((((((,{...{{{{{||||{{.|||}.((((((...((((((((.....)).))))))......)))).)}((((((((({((((({,((......(((((....)))))....,..))))))))|(((....(((((,{,(((...((((((((((,.((((((((((...}))))))))).))))))).....))).))).((((((,.((((((((((((....))))))))...})))))))))....,},..))))).))),.))))),})))......,((((((((((((((({...........))))))))))))))))||||{|||||,.,,}}}},,,,,,{{{{.,||||{{{{((((((,{((.............,..)))))).)))||||||,||||.((.......{{.{(((....)))}.))....,...)))))),,))))}}..)))))))))),,))..(((((.((((((((.....,,......................}}.,...)))))))))))))...))))))).})))))....))))).....))))))))))))..)).))).))))).))))))).).))).))))))..,).}).)))))))))....))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).)))))))),||.(((((.,.........)))))..,,,.......(((((((......))).))))...))))))}}))).,,,,,,))).))}))),,....)))))}.|||||||{||{......,,,,,))))}}))))}...))))))(((((..((((((((((........)))))),,})))..))))),.||.}}}))},))))...))))))))})).)}{(..((((((((...((......)).)))))))),.)}))...}}.))))))))).,,,)),,,}))|||}((.{((,....,.))).))..,(((((((((,,...........(((((..((.(((.(((.{..(((((((((({....})))))....))))).}.))).)))))..)))))..,,))))))))).....))))))))).)))))),.((((((((.((((((((...((((...(((((..{(.{({,.....,,{|||...}}}}},,,....)),),.))))).)))).)))}}}))))).))))))..(((((({..((((..(((((((((..{({.....})}))))))))).))))))))))),{....}}...,))))..))).)))))....)))).))).)))..(((((...))))))))))..))))).)))}}}.))))...)))))))))..)))){((((......))))},{.......},......((((..((((.....))))..))))(((((((.,{,....(((.((...)).)))...,,,..))))))))))))))..})).)))}.)))))).))))).,{(,{{{...((((((((((....))))))))))..,}}}.}}}{{(((....)))}}...)))))))))).}}}((((((((((((((....(((....)))....)))))))))))))).....(((((...)))))..,))))}.}}}.....(((((((.......)))))))....))).)))))))))))))))})))...))))))))))))))))).,))}..,..,.,|||.((..(((((((((((..................)))))))))))..}|,{,,.{{,.....{{(,.,(((((({..((((((((((((((,..,{{{{{{.....(((((((.......)))))))................{(((.(((({.{{{,,...,}.}}})))))))))..........{{((((((((....,|.,,},,,..))))}}))}}..|{{{{.{((((((...((,{,(((((((...........))).)))).,,))...)))))))...))))),,,||{{{|{{{{|....)})))}....)))}}}}}||||......{(....{(((....}}}),,}}.(((((({.(..({(((...,,,(((..((({.{,{({.,....}))).}.))))...})).,..}))))..}.))))})}..))))))}},,}))),}})}}},}}},.))).....,},}},.,||},,...,|.}},||{{{({.,.}}})))}}}))),..})))))))}|}})})}}}.)))}},|,{{((.((((((({{{(((((((((((...))))))))))}...........}))))))).))).)))}.........((((({((((((((((({{((((...(((.,((((.,,....,,....)))}.)))....))))}..))))))..)))))).)))))).,{{{{{{|........,,,)))))))},}|}}},..},,,}}})|||||||,..{||||||}},})))|||{||||||.,..||||,},,..}}))}})),..}}})))))))))))))))))))))))))))))))).(((.((({,..(((((((((((((((((.....))....)))))))|{(((((((((((({...{{((,{,.{((.((........)),))}.}}.}|||{{{{.{{........}}.}}}||||{.,((((({{{...,{{{,|{,||,,|,.{{||,||}},||{{,,,,}}|,,}||||,{,{{|.,{{{.(((((....))))).}},{((.(((((((...{......))))))).})),,,..}}}}}}|||||{.,,,,.....((((((.((((.((({,,,,.{((((({((((........)))).}}},}}||{((({.,{{(({(((((((....))))))}........,)))))}})))}}|{|}|{{..((((..........)))).,)))))}....))))).))))))))))...)))),))))))|{(((.....,.}))}}.....})))))).)))))))}.)))))))))))).})),((((((....(((((.{{{..........(((......)))..........}},.)))))...)))))){(((((((((((.....)))))..}))))))))))))))),.}))))).))))))))))))))))}}}))),,(((((((,{{,{,{,(,,,..||}.||.,(((((((((..{{{.....{({|...)))).....}}}..}))))))))))}||.},.,||,.(((((((((((.....{(((({((,(((((((...,,,|}}}}})},)))}}})),,,,||,{{{{{{{{{{{.((.,({((.,,,,...},,),)),))))))))))...(((((((..((((((........))))))..))))))))))))))))))},,..,)}..,))))},)))))))))))).)))........)}..)))).)))))}.,))).))),)}..,},,}||||{,,,|}}}}.,,,|((.((((((((.((((...)))).))))..)))).)),))))))))}..)))))))))..,).)))..,,,..}}).....))))).))))))))).))))..))}.,,,......}}}))))))..)))))).........})))))}},,}},...|||}||||||||}}|{,....,,||||,}||}}}}|,|||{{({....)))}.((((.((((.((((((((((((...(((......(((((.((({...(((......)}),,.),,}).)))))...)))..)))))))))))).)))).))))...}})})},||||}.,,|||||.|||((((,.,,}}}}..(((((((((({..((((((((........))))))))...}))))))))))..{{((....}}},............(((((((((....(((((.((((.((.(((((.{((({...||}||..{(((({{...,)))}}}},{(({{{...}}}}},.|,{||,,..))))),,..))))))).)))).))))))))))))))....))))))))...)))))).)))))))))))))))))},||.((((.,,.....,..)))),....{((((((..,..{{{{{......(((((((((((((.......)))))),|{{{,((((((((.{((.((((((((...............(((((...}))))......((((((((((,,........,.})))))))))...{{{|.....|||{{{,.(((((......)))))..}))}}.......,|||......,((,....,.................,||,...}},)},}},..}}}}}.,|.||||.,,........}}}}}}}.)))))))).))}.)))))))),))}|.........}})})))...,,,))))}.,.)))))))...{{{{...............}}}}{((.(((((((...{{({,.,{(,..((((((((((.........)))))))))).,.}},....,||.....,,,|,..(((({,(.((((((.(((((.((((..........))))))))}........))))))))))))....((({.{..(({.,,.(({(({..{{{....)))))))))....}}}..|}}}}..{{{......}}}.....))))).))))))).))))))))))))},....,))))))))).))))).))))))))).,||........},}}|}}}}.,.,..,||,|||||||}.(((((((.{,......},..)))}}}},....}}}}|||||||.(((({{...((((((...((....}}...)))))).)))})).(((((.((.((((((((((((...((((((....(((((((((((.((((((((((((((....(((((({.((((((.((((.((((((.((.(((..(((((..(((((...{({.(((((.(..((((((((((((.((((.(((((((((...((((((.(.(((((((((((((.((((((((..(((((((.(((((((..,,....(((.(((((,.{(((((((..(((.((...(((((((((((((((((.((((((,,,({{,,{..,,,)},..,,..((.((((......)))).)).{{{(((((((..(((({{...(({(((((..(((,..((((....(((.((((((((..((......,{....{{,.((((((({,,({{{{{.,,)}}}}}.((((((((..(.((((((((((((((..(((((((((((((((((.((((((((((,..}|{{....{((.(({{....}}}}.,,},.|{..{{{((({.(((((((.(((((((..(((((..(((((..(((((.{{{{((((.(((.{......,).}}).))||||||...((((((....)))))),,,,,,.)))))...))))))))))..)))))))..........(((....,|||.....|,....}||{,,....,)),((((((((....((..((((((......{{(((,.((((((..{,,({((.,.{{{{{(({{{((({((,((({({...,{(((((((((.{{{{......|}}|((((.........}}}}}.,,...,||(((({.....{||{{||...||,,,,,.(((((((..((((..((((...))))....)))).)))))))....||,,.}}}}}}}.,.,))))}}})))))))))||(((({...}}.)))}|(((,,,(({.....|||,{.||}((.,,,,,,,||{||{,}},,.{{{{{{.......{{(({{.,,....,||}|||...,(((...,,,|{((.,((((.(((((({....))))))).))))}.})}||,,.,|||..,,,,,}}}..,)))))}}}.....,,..||||||..|||||||{||..{,(((,,{{||}}...,{{|||,,.,|||,..,}}...}}}}}}.|{{|||||}.}}}||...,||{(((,{.,,,,||..,|||,,....{((.(((.(((.......)))..))).))}..||........,,......................,,,,,,,,,...........,{{{{,.,,.{{{{((((.,(((........{{{{||..|||.((((...{(((((((((((....}.)))}.}))),},}.)))}.{|,..}|||,,||||,||||||,..,||||||..,,,},|||||||...},||,}}}}|,.,,|...||.,,......}})))}.}}})|,,,...}}||||||.{{||||||||||{,,,,,,..))))))))))}}.,{{{,{||({{,,{{{{{{{|..{{{.,(((((.(((.((((..(((((...........)))))...))))..)))...))))))|||||||||||,|,||{||,..,}}}|......(((......)))..}}}}},,,)))|}}...{{((......||}},...|||,.,||{|(|(({{||.{.(((((((((((((((((((((((((((.(((((.{((((((........))))))}.)))))..((.((((.(((.....))).)))).)).)))))))))))))))))))))))))){{{{{|||||{{{{||||}}}}|||,.((((((...|||||,..,|||||...)))))).,,,.....,|{{|||{,,,.,,,,|||||}}||((({{{{,,(((.(((((({({......}})))})).}))))}}||}.|||||..{(((.....((((((((((((.....(((((((((((((.(((((...,.((((........)))).}...)))))...)))},))))))))){((((((((((.((.((...(((({({,,,,|}}}})|||,{((({...((((((...,.((((((((...((((,(((((((((.((((((({({({.,((|,,,|{{((((({..((((,..)))).)}))))}}}|||,},),)))))}|.........,|||,}}.})))....,))))))))))))).(((.({{(((.((((((...((((((.,....,.)))))).)))...))).))))).)))......)))))))).}....)))))).))))}|||{{.......|((((((((({{((((.((((.....))))..))))))).)))))))}((((.....)))}....}}},,)).)))))))..)))))|((((((........))))))..)))))))))))).)))}....(((((((((...))))))))).,...,((({{{{,,,.,}})))}}),,,,},},}},,,}})))}}}}).}}.....}}}})},))))))))}.|})},,,,,)))..}))))))})))}...,))))}}}},})))..)))).,}..))))))..))))))))))).,..))...)))))))}(((((........))))).))))))}....,,,..(((((((((.(({......))))))))))))..,.}})}}}..||,........))).)))).)))))},))))))))...,,,...{{,......}}},......(((((((((.....))))))))),({{{.....,,.)},,,,......)))..)))))))))))))).)..)))))))).}))))))).}}}.......)})))))))).)))..))))})),.)))),..,)))}.,,})))}..)))).))).}}),,,,,........(((((..(({{((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((({,,((((((.((.((((((((((((.((((.((((((((.((((.((((((((((((((((((({........((((((((.,{,..((......))..,,},))))))))((((..((((((((,,(((((((((((..((((((((..(((..{(((.((((....)))))}}}.(((((((....)))))))(((,({,...,)))))..((((((...)))))).....}))..))))||)))..)))}..{(((((.......}))))}.,...{({{{{,,,..,..,,,,...,.,.))}))).....))))))))))))..{(((((((.(((({(({,(((..........,)))))).}..)))))))))).)))))).))))....{{{.(((((....)))))......{{{.{(((((((.........{(((.,.....(((...))).......)))}......)))))))}.}||||}........((((...}))).....,{.....,||,,,,||,{{{{{({.,((,......,,....}))}))}}.,}}}}}}}.,,,}|||||}....,},,}},}))))))))))))))))))).)))).)))))))))))).)))))))))))),)).)))))})..)))))))))).))))))))))))))))).))))))))))).))).))))))}}))..))))))))},.}})))).,..))))))))))))))))).,.)).)))..))))))))))))).)))...,,...))))))).)))))))..)))))))).))))))))))))).).))))))))))))))).)))).))))))))))))..).))))).})}...))))))))))))).)).)))).)))))).)))))).})))))))))))))))))))).))),.............)))))))).....))))))...)))))))))))).)).))))),{{,......(((((.....))))).......}}})}})),,)),.......}}))))))))|))|||...,|,..|||||.,........,,,},.{{{{{{,,,,,))))))||{{.{{,{|.,,..||.,.,{{||,,,,,.}}))},}}},.....,,}}}..,,}),}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000636.4 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 14167 nt 0.4153
NM_001024465.3 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 997 nt 0.4804
NM_001024466.3 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 880 nt 0.4807
NM_001322814.2 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 14050 nt 0.4147
NM_001322815.2 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 13987 nt 0.4143
NM_001322816.2 NCBI
ACUCGUGGCUGUGGUGGCUUCGGCAGCGGCUUCAGCAGAUCGGCGGCAU… 2042 nt 0.4515
NM_001322817.2 NCBI
AGGGAUCCCGCGGCUCCUCGCGGCUUGGCCUGACCGGCUUCCUCCACAU… 2365 nt 0.5311
NM_001322819.2 NCBI
GCCUCCCGCCAGCCUCCCCGCUCCGCCAUGUUCGCCUUCUGGCCCACUC… 14189 nt 0.4161
NM_001322820.2 NCBI
AUCCGUGAUGCUUCCGCGUGUCGGAGGACCAGGUGCCACCUCAAGAGAG… 14169 nt 0.4152
Summary

This gene is a member of the iron/manganese superoxide dismutase family. It encodes a mitochondrial protein that forms a homotetramer and binds one manganese ion per subunit. This protein binds to the superoxide byproducts of oxidative phosphorylation and converts them to hydrogen peroxide and diatomic oxygen. Mutations in this gene have been associated with idiopathic cardiomyopathy (IDC), premature aging, sporadic motor neuron disease, and cancer. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 1. [provided by RefSeq, Apr 2016]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that the SOD2 gene expression was significantly increased at 24 hours post-exposure to cutaneous bromine injury [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007]. In human forensic research, cultured fibroblasts from sudden infant death syndrome (SIDS) cases and control infants showed that the SOD2 expression was elevated after thermal stress, with the control group exhibiting higher expression levels than the SIDS group at all measured time points, reaching a significant difference at 12 hours [Rohde et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2013.06.003]. A study in mice demonstrated that the SOD2 was over-expressed in liver tissue following Kupffer and endothelial cell-specific exposures to α-particles and was under-expressed after neutron exposure, as identified in a microarray analysis of radiation-induced gene expression changes [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078]. In human corpus cavernosum tissue, single-cell RNA sequencing revealed the SOD2 was upregulated in endothelial cells from patients with erectile dysfunction, associated with a cell death response to oxidative stress [Zhao et al. DOI:10.1038/s41467-022-31950-9].