Basic Information

Symbol
BAZ1B
RNA class
mRNA
Alias
Bromodomain Adjacent To Zinc Finger Domain 1B WSTF WBSCR10 WBSCR9 Williams-Beuren Syndrome Chromosomal Region 10 Protein Williams-Beuren Syndrome Chromosomal Region 9 Protein Williams Syndrome Transcription Factor Tyrosine-Protein Kinase BAZ1B Transcription Factor WSTF EC 2.7.10.2 HWALp2 Bromodomain Adjacent To Zinc Finger Domain Protein 1B Williams-Beuren Syndrome Chromosome Region 10 Williams-Beuren Syndrome Chromosome Region 9 WBSC10
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_032408.4
Sequence length
6115.0 nt
GC content
0.4796

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1903.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2013.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1239.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((..((((((((((((((((((.((.((((....)))).)).....(((.....(((((((...........)))))))...)))(((((((((.(((..........))).)))))))))((((.((..((((((.(.((.((((.((((((.....)))))).(((((((((((((((.(.(((((((.(((....)))))))))).).)))).))))....))))))).....)))))).)))))))..)))))).))))))))).)).)))((((.((((((((.(((((((((((.((.((((((((.(((((((.......((.....)).......))))..))).)).)))))).))..))))))).......((((((...)).)))))))).))))))))..)))).(((((((((..(((....(.((((....((((((((....((((............))))..))).)))))....)))).).....))).))).))))))((((....))))))))..)))))).(((...))).(((..(((...((((((((((((((((.....(((((((...)))).)))(((((((...(((((((.(((..........))).)))).)))((((...(((.(((........))).)))....)))).)))).))).....(((((.((.(((.((((((..(((((.((((.(............((((((((((..............(((((((((......(((((.........))))).........(((((((((.((((.((.(((......(((..........)))......))).).).)))))))))))))...................)))))))))((((((........(((((.(((........))).))).))........)))))).(((((((.......(((((((.....(((......)))...))))).))(((((.......)))))........)))))))......((((((((.....((((((..............(((..((((.....((......)).....))))..)))........(((...))).......)))))))))))))).....)))))))))).........).))))..)))))..))))))))).))))))))))))))))))))))).)))..)))((((((((((((((.......(((((((.((..(((((......((((....))))((((.(((((..........(((..(((((......(((((((((((((((((..........((((.((.((((.(((...((((.((.(((((((((((((....)))))))..))))....(((((.((((((((..(((.....))).(((((..............))))).(((.((.......)).)))(((((....((((((((((((.....((...((((.........))))...))((((((....((((....))))...((((((......(((.((((....((((......))))..((((..........)))).....((((........))))...(((((..(((((((((((..(((((.((.....(((...)))..................(((((.(((....))))))))....((((.....))))....))..))))))))))))((((((.(((((...(((((..............(((.((((..(((((((.(..(.....)..).)))))))...)))).))).......(((((((((((........)))))).))))).(((((..(((((.((.(((................))).))...))))).))).)).....))))))))))(((...((((........)))).)))................))))))..((((...........(((((.....((((...(((...............(((((..................)))))...............)))...)))).....))))))))).))))..)))))))))...)))......))))))....))))))))))))))))))...))))).)))))))))))))((((.((((.(((((.((.......(((((.(((((......)))))..)))))......)).))))).))))))))...(((((((((....(((((((...))))))).)))))))))..........)).)).))))))).)))).))...)))).)))))))))))))..))))))))))))..(((((..((((((((.........((((((((...))))))))(((((((.((....((((.((.(((((...((..(((.(((...((((((.((.............)))))))).......((..((.((((((..((.........((((.....(((((((..((........))..)))))))...))))))..))))))))..))))).)))..))..))))).))))))..)).))))))).((....)).....(((((.....)))))))))))))..))..)))..))))).))))..(((((((((((((((((((.(((.(((((.((((.((((...(((.......(((.((................((..((((((.(...(((((((((.(((((.((((...........))))..)))))..))).............(((((((.....(((.(((((((((((..((((((....))))))..)))(((.(((.((((((.((((...((((((........(((((..((((..(((((((......((((.(((((........((((((.(..(((....)))..)...)))))).((((.(...((((((.(((.......))).)).))))..)))))....((.((((((............))).)))))))))))))).....)))))))..)))))))))........)))))).............(((((((.(......(((((((....((((......))))((.((.((.....(((((((((((......((((.(((.((((.((((..........((((.........))))..((((((((....))))))))...(((...((((...((((.(((......)))...))))...))))...)))....((.(((((.(((((((....((((((((((((.((.((.......(((..(((..(((......((((...((((.((((...(((.(.((((((((((....(((((((((((((.((((.....((((.....)))).....)))).(((.((.(((((....(((((((....(((((((..(((......)))..)))))))...)))))))........((((.......))))........))))))).)))..........((((((((....(((.((((((((.(((....))).)))...))))).))).......))))))))..((((.(((.((((((((((((..............((((.........(((((......)))))....))))........................(((....)))((((.(((((((((((((.(......(((..........)))....))))))))))..)))).))))))))))))).)))))).))))(((((......))))).)))).......)))))))))...((((((((.................)))))))).(((......)))))))).))))).))))...)))).)))))))))))...)))..)))........)).)).)))))).))))))...))))))))))))))....((((((((........)).))))))......))))...)))).))))))))))))))))))..)).)).)))))))))...(((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((.(.......(((((..........)))))......(((((((((((..(((......))).((((..((.(((.((((..((.(((....(((....)))))).)).))))..))).)).)))).))))))))))).(((((....(((((.(((((......(((((((((((((.(((...(((...(..(((((...((.(((((((.((((((((......))).......((((((.((((.(...((((...)))).).))))...)))))).))))))).(((((..(((......)))..)))))..))))).))..)))))..)....)))))).)))))))).))))).(((((((((((....(((((((((.......((.(((((((.(((...((((((.....(((((((...))))).)))))))))))))))))).))......))))).)))))))))..))))))((((((((.(((((((.((((.((((..((((((((.......))))))))...(((((((((.............))))))))).....((.(((((...))))).)).....))))...(((((((((((((((((((((((((.........((((((((((........)).))))))))...)))))))......(((((((.((((((((((.((...((((((.((.((((.(..((..(((.....))).))..))))).)))))))))))))))).....................)))).))))))).................(((((........)))))........))))))))).................))))))))).))))...))))))).)))))))))))))))))))))))).)).)))))))..(((((....)))))...((((((((((((((((.((((....)))).))))))......))).)))))))...........(((((((((((((((((.((..(((......((((((.((((.(((.(((.(((((((..(((....))).)))).)))...))).)))...)))).))))))....)))..)).)))......(((((((((((.(..((((.....))))..).)))))))))))....))))))))))))))......((((((((..((((((..((((((.(((.((.((((((((.(((...(((((((..(((((((((.((.(((......))).)))))))).))).)).)))))..))).))))))))))))))))))).....))))))....))))))))...............((.((((.........))))))...))))))))))))))))))))))))...........(((((((((...(((((...)))))...))))))))).((((((((..((.......((((......)))).......)).))))))))(((.(....))))((((((....(((((..(((((........))))).)))))..)))))).......))))).)))))))).)))))))((((..((((((......))).))).))))...).)))))))..)))).))))))...))).)))....)))))))))))..))))))).))))))........)))))))..)).)).)))....)))..)))))))))))))..((((.((((.....)))).))))((((......))))....))).)))))))))))))))))))...)))))..)).))))))).(((......)))((((.((.(((....))).)).))))........))))))))))))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..((((((((((((((((((.((.((((,...}))).}}.....{({.....(((((((,,,...,},..)))))))...))}{{(((((((.(((..........))).))))))))|((((.,{..(((((({(((((.((({((((((({{{.,,||||....|}}},,,|||||.|,,|||,||}||.}}})))))||,|||{{{||,|,{||,,....},)))),))))))))))}))),}))}}),}))).))))))))}.)),)))((((.((((((((.(((((((((((.((.(((((((({(({{(((....,..{,.,...},.......))))}},))})}.,))))).))..))))))).......((((((...)).)))))))).))))))))..)))).(((((((((..(((,({.(,(({{....((((((((....((((............))))..)))})))))..,,))}),).....))).))).))))))((((....))))))))..)))))).{({...}}}.(((..(((...(((((((((((((((({{,.,(((((((((((({|{{...}}}.}.)))))},,{,{(({..{{{{....)))},,},,)))}}}}}}.}}|.,{,.{((,,..,))))}|((((||....}.))))))....{((((.((.((,,((((((..(((((.((((,(,.....,.....((((({((((.....{{{{....{(((((((((......{((((.|.......))))}.........(((((((((.((((.(,,{{{...,,.,.({{{...|,..,,}...}}})}},,,}.))))))))))))).........|..,,.}...}}))))))}|{,,,(,,,.,.,.{{,{{.,{,......,,}}}.,.},}}}.,.....}}||||.||||,|,.......||||,,||,,,.|{{,},,}))),...))))}.}}||{{{.......||||....,,|,..,||,.|......||||||{{...,{((((({...,,{{{{{....(((..((((...,.((......)).,...))))..}})....,..,((,...}))....}}}))))}}})))))},.....)))))))))}},}......).))))..)))))..))))))))).))))))))))))))))))))))).)))..)))((((((((((((((.......(((((((.((..(((((..,...((((....))))((((.(((((..........(((..(((((......(((((((((((((((((........,.((((,((.{(({.|||,.,||{{.,{.,{(({((((((((....))))))),.}}}}....((({{{((((((((..{(,...,..,..(((({.........,.},.||,|}.(((.((.......)).)))(((({....{(((((((((((....,((...((((.........))))...}}{(((((....((((,,..}}})...{{{{{{..,|,,||}},{(({{..((((......)))},.((({..,.......)))).....((((........))))...,{{{,..{((,{((({{{..||{{||({....,(((...))).,{{{.....||....,.(((((.(((....))))))))....((((,...,))))....,},,)},,.)}))))){||{{(,(((((,.,(((((,{{{,.........{{{.{{{{..(((((((.(..(.....,..).))))))){|,|}}},|||,,,....((({{,(((((,{,,,...}}}}}}.}||||,,{(((,,,{{{{....{{{...{,,,.{{,,....,}}..},.,)}|||.}}}.||....,}}}))}}})}{{|...{{{{........))}}.}},...,||......,,..}))))))}|||.........||{{{{((.....{||{...{||..,,,,,,...,,..,||||,.},,,,.......,},,}}))),.,,,,,,{{{,,,,||}..,|||}.....}})))))),,)))}..)))))||,...|}}}}.,)))))))}}....))))))))))))))))))...})))),)))))))))))))((({,((((.(((((.((.......(((((.(((((......)))))..)))))......)).))))).))))))))...(((((((((....(((((({...})))))).))))))))),,,...,...,|.}}.}}))}}).)})).)}...)})),)))))))))))))..))))))))))))..{((((.,(((((((({.{{{{{,.((((((((...))))))))(((((((.((....((({{((.(((((...((..(((.(((...(((,((.{,........,,}.}))}})))),,.,...{(..((.((((((..((,|{,,,...{{||,,...(((((((..{{........)}..)))))))...}}}}})..))))))))..)}))).)))..))..))))).))))))..)).))))))).,,...,||...,,|{{,|}}}},,},,))))))))),.))..)))..))))).))))..(((((((((((((((((((.(({.((((({(({{{((((...(((.......(((.((................((..{(((((.{...(((((((((.(((((.{(({...........))})..)))))..))).............(((((((..,..{((.(((((((({((..((((({....})))))..))|(((.(((.((((((.((((...((((((........(((((..{(((..(((((((..,,..(((,,(((((........((((((.,..(((....)))..}...))))))}(((,.({..((((((.(((.......))).)).))))..)))))...|((.((((((............))).)))))))))))))).,,..)))))))..)))))))))........)))))}...,,....},,.(((((((.,.,{...(((((((,...((((......)))).}))))))).,..(((((((((((......{({{((((.((((.((((..........((((.........))))..((((((((....))))))))...(((...((((...((((.(((......)))...))))...)))).,.)))....((.(((((.(((((((....((((((((((((.((.((......,({...(((..(({....,.{(({...((((.((((...(((.(.((((((((((....(((((((((,{({,{((,..,,{{|{|,,.,,,,,{{,{(((({{..(({{(.{{{(({{,.(((((((..,.(((((((..(((......)))..))))))),..)))))))..||||,..|{|,,.....,)))}}.,,,}}}}}))))})))|,||{|,...{{((((((....{{{.{((({{{{.{{{,...,)),}}},..))))).))),,.....}}))))))..((((.(((.((((((((((((.....,.......|{|{....,.....{{({{......|}}}},.,|},.,,,..............{{{{,...{((....}}}{{{|}|||,(((((((({,(......|,{..}},,,...,}),...})))))))))..)))}.,}))))))))))).)))))).)))),,,||..{{{{|,....))))}......))))))))).,.{((((((({...............})))))))).(((......)))))))).))))).))))...)))).))))})))|||{..}}},)))}........)).)).)))))).))))))...))))))))))))))....(((((({(.,......)).))))))......))))...)))).))))))))))))))))))..,|.||....}}.}}....(((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((,,..,,.,.(((((..........)))))},.,},(((((((((((..(((......))).((((..((.(((.((((..((.(((.,.{({,....)),))).)).))))..))).)).)))).))))))))))).{((((.,,.(((((.(((((,.....(((((((((((((.(((.,,,,,.,,,..(((((...((.(((((((.((((((((......))).......((((((.((((.,...((((...)))).}.))))...)))))).))))))).(((((..(((......)))..)))))..))))).))..)))))..),...,))))).)))))))).))))).((((((({(({...,{((((((((....,..((.((((((,,(((...((((((.....(((((((...))))).)))))))))))))))))).))......))))).)))))}})).,)))))),(((((((.(((((((.((((.{(((..((((((((.......))))))))...(((((((((.............))))))))).....((.(((({...})))).)).)...}}}}...((((((((({(((((((({,{{{{,.{,{,.,,,((((((((((,{,,....}}}))))}}},...,,,,,))......(((((((.((((((((((.{{...((((((.,{.((((.(..((..(((,...,))).))..))))).))))))))}))))))).....................)))).))))))}.................,,,,|}}}}..}}))}}),.))))..))))))))|,,,........,,,...))))))))).))))...))))))).))))))))))))))))))}))})),),.)))))))..(((((....)))))...((((((((((((((((.{,((....,,}),))))))},,...})).)))))))...........(((((((((((((((((.((..{{{......((((((.((((.(((.(((.(((((((..(((....))).)))).)))...))).)))...)))).))))))....}}}..)).))),,....(((((((((((.{..((((.....))))..).)))))))))))....,)))))))))))))....,{(,.(((((({.,((((((.(((.{.(((((((((((((((.(((...(((((((..(((((((((.((.(((......))).)))))))).))).)).)))))..))).)))))))}.....}))))))).,))).))}...,)))))))))),.}},........((.{{((,.,....,.)}})))...))))))))))))))))))))))))..,.((((({{((({{,,,({{{(,{,,,,{|||||...,,|||},,}.||,||||,..||,,,....((((......))))...}})}),.,,)))))))))){|{,,{||.((({{{,,,.{{{{{..,(((,.......})))},.}}}},..||||}}...,}}}))))).)))))))).)))))))((((..((((({......))).))).))))...}.)))))))..)))).))))))...))).))),...))))))))))),.))))))).))))))........,)))))),,}}.)).)))....)))..)))))))))))))..{(((.((((.....)))).)))|((((......))))....})).))))))))))))))))))),,.)))))..)).))))))).(((......)))((((.((.(({....})).)).))))........))))))))))))))..............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGUGUGUGCGUUGGCCGGGCCCGGGGGAGGAGGGGAAUCUCCCGCCAUU… 6602 nt 0.4823
AGUGUGUGCGUUGGCCGGGCCCGGGGGAGGAGGGGAAUCUCCCGCCAUU… 6115 nt 0.4796
Summary

This gene encodes a member of the bromodomain protein family. The bromodomain is a structural motif characteristic of proteins involved in chromatin-dependent regulation of transcription. This gene is deleted in Williams-Beuren syndrome, a developmental disorder caused by deletion of multiple genes at 7q11.23. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice and rats demonstrated that chronic cocaine exposure alters levels of the BAZ1B in the brain [Nestler DOI:10.1016/J.Neuropharm.2013.04.004].